166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2044 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2044  porin  100 
 
 		 294 aa  567  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  78.98 
 
 		 296 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4335  porin  79.25 
 
 		 294 aa  391  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1624  porin  82.94 
 
 		 285 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  77.55 
 
 		 287 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4907  porin  76.01 
 
 		 296 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  76.01 
 
 		 296 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3321  porin  77.82 
 
 		 285 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7845  porin  76.27 
 
 		 287 aa  374  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190915  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  72.2 
 
 		 289 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  72.64 
 
 		 290 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  72.2 
 
 		 289 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3108  porin  71.62 
 
 		 290 aa  361  6e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0475237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2882  porin  71.62 
 
 		 290 aa  361  6e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4355  porin  73.47 
 
 		 288 aa  358  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.64859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3986  porin  73.47 
 
 		 288 aa  358  4e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0565804  normal  0.846216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4466  porin  73.13 
 
 		 288 aa  357  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0474  porin  69.18 
 
 		 302 aa  329  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  57.19 
 
 		 302 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  60.14 
 
 		 277 aa  278  7e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  62.96 
 
 		 276 aa  275  9e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  58.39 
 
 		 279 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  60.94 
 
 		 278 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  57.95 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  58.11 
 
 		 276 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  56.29 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3379  porin  56.51 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  49.17 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  53.47 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3299  porin  51.5 
 
 		 287 aa  209  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.466189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  46.25 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  42.26 
 
 		 283 aa  182  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  42.76 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  42.76 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  41.42 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  41.42 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3848  porin  45.83 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  40.62 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2867  porin  41.03 
 
 		 285 aa  146  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  42.14 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2142  porin  43.87 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  37.17 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  34.09 
 
 		 240 aa  109  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  34.19 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  37.41 
 
 		 571 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  37.5 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  39.02 
 
 		 232 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  41.41 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  34.46 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  35.27 
 
 		 583 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  36.24 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  31.65 
 
 		 254 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0836  porin  43.11 
 
 		 254 aa  99  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0404918  normal  0.853535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3546  porin  43.64 
 
 		 245 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  34.62 
 
 		 452 aa  97.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  33.33 
 
 		 244 aa  96.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  34.54 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  36 
 
 		 447 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  40.3 
 
 		 236 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  35.43 
 
 		 453 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  31.68 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  32.19 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  39.38 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.85 
 
 		 206 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.9 
 
 		 206 aa  85.9  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  35.27 
 
 		 229 aa  85.5  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  32.83 
 
 		 230 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  30.91 
 
 		 206 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  32.83 
 
 		 230 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  29.35 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  35.45 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  30.03 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  31.08 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  34.48 
 
 		 710 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  31.28 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  28.85 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.35 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  32.46 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  32.58 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  27.96 
 
 		 236 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  30.53 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.28 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  30.51 
 
 		 577 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  31.23 
 
 		 454 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  31.2 
 
 		 692 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  33.03 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  33.87 
 
 		 215 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  33.52 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  31.53 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  31.29 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  30.11 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  33.63 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  34.95 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  35.27 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  29.58 
 
 		 570 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  32.73 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  34.67 
 
 		 255 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  30.11 
 
 		 693 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  30.52 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  34.22 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>