199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5167 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  100 
 
 		 236 aa  471  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  68.62 
 
 		 237 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  66.52 
 
 		 240 aa  317  9e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  67.23 
 
 		 236 aa  314  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  67.08 
 
 		 237 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1337  putative outer membrane protein  69.23 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1666  OmpA-like transmembrane region  67.76 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  57.02 
 
 		 251 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  56.05 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  55.76 
 
 		 238 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  52.63 
 
 		 242 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  53.41 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  53.88 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  49.2 
 
 		 241 aa  189  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  50.66 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7235  putative outer membrane protein  54.92 
 
 		 193 aa  185  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  38.49 
 
 		 254 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  38.96 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  37.97 
 
 		 237 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  34.39 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  36.43 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  38.55 
 
 		 245 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  40.2 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  36.48 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  42.78 
 
 		 274 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  34.63 
 
 		 559 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  36.43 
 
 		 251 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  37.5 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  36.55 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  31.7 
 
 		 570 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  33.2 
 
 		 562 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  40 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1567  putative outer-membrane protein precursor  36.68 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  34.98 
 
 		 454 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  33.08 
 
 		 566 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  36.48 
 
 		 452 aa  98.6  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  37.32 
 
 		 447 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  30.45 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  35.44 
 
 		 997 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  33.71 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  35.45 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  36.68 
 
 		 561 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  35.06 
 
 		 241 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0429  putative 31 kDa outer-membrane immunogenic protein precursor  36.82 
 
 		 219 aa  95.9  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.22814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  33.46 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  32.82 
 
 		 570 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  35.06 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  32.64 
 
 		 692 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3979  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.86 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  34.13 
 
 		 453 aa  92.4  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2080  putative outer-membrane protein precursor  34.07 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.366829  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  32.66 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6718  hypothetical protein  41.34 
 
 		 550 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  36.36 
 
 		 246 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  33.2 
 
 		 240 aa  89  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  32.28 
 
 		 248 aa  89  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  34.76 
 
 		 449 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  33.94 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4376  putative outer-membrane protein  30.84 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36541  normal  0.0609964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  32.47 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3614  putative outer membrane protein  33.79 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  32.5 
 
 		 578 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  28.15 
 
 		 693 aa  85.1  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  31.33 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  30.29 
 
 		 571 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  33.88 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1543  putative outer-membrane protein  31.43 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  31.7 
 
 		 662 aa  82  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  31.34 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3564  carbohydrate-selective porin OprB  30.8 
 
 		 724 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4525  putative outer-membrane protein  32.3 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  29.89 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  29.89 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  30.58 
 
 		 689 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4249  Carbohydrate-selective porin OprB  30.18 
 
 		 670 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  31.6 
 
 		 661 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  29.03 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3415  putative outer membrane protein of unknown function  28.3 
 
 		 680 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  30.62 
 
 		 710 aa  76.3  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1454  hypothetical protein  30.8 
 
 		 665 aa  75.9  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0329  carbohydrate-selective porin OprB  31.47 
 
 		 674 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  30.15 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  29.72 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  33.75 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  30.74 
 
 		 652 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2763  putative outer-membrane protein precursor  32.24 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  29.79 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  32.7 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.39 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.87 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  28.78 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  32.02 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  25.86 
 
 		 228 aa  72  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  35.02 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  34.69 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1699  hypothetical protein  26.11 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.013391  normal  0.0555253 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  33.8 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.65 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  29.27 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000209958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  31.16 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>