69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3979 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3979  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  100 
 
 		 262 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.97 
 
 		 236 aa  95.5  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  33.58 
 
 		 242 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  35.19 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  36.03 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  35.4 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  33.96 
 
 		 237 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  33.33 
 
 		 237 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  31.2 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  33.58 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.47 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  35.24 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  31.73 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  28.85 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  32.2 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  29.34 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  31.34 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  33.58 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  33.91 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  30.71 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4376  putative outer-membrane protein  32.96 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36541  normal  0.0609964 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  29.3 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  30.95 
 
 		 449 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  28.32 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  35.26 
 
 		 454 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  29.15 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  34.2 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  40.09 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  32.34 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  33.17 
 
 		 447 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1666  OmpA-like transmembrane region  29.63 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  31.08 
 
 		 449 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  30.36 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  31.11 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1337  putative outer membrane protein  29.1 
 
 		 241 aa  52.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  31.82 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  28.36 
 
 		 245 aa  52.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  32.26 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  28.36 
 
 		 247 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  28.85 
 
 		 997 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4129  putative outer membrane protein  27.35 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  36.89 
 
 		 288 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  28.89 
 
 		 296 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  27.54 
 
 		 566 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  29.69 
 
 		 562 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  27.73 
 
 		 570 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  29.71 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  29.75 
 
 		 570 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  25.29 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  30.87 
 
 		 561 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  28.21 
 
 		 290 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  30.14 
 
 		 274 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  30.14 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  29.41 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  28.7 
 
 		 559 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3108  porin  27.78 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0475237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  26.58 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  29.46 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2882  porin  27.78 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  30.77 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7235  putative outer membrane protein  28.57 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  30.67 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4335  porin  29.6 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  29.21 
 
 		 571 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  31.82 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4466  porin  29.44 
 
 		 288 aa  42.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  26.32 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  27.71 
 
 		 578 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  31.51 
 
 		 279 aa  42  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>