135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4376 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4376  putative outer-membrane protein  100 
 
 		 260 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36541  normal  0.0609964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  55.89 
 
 		 251 aa  274  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  56.15 
 
 		 246 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  53.46 
 
 		 237 aa  251  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1567  putative outer-membrane protein precursor  54.85 
 
 		 258 aa  239  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1543  putative outer-membrane protein  49.8 
 
 		 258 aa  231  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  52.31 
 
 		 241 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  50.77 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2080  putative outer-membrane protein precursor  50.19 
 
 		 251 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.366829  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  48.11 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2763  putative outer-membrane protein precursor  50.88 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4525  putative outer-membrane protein  47.81 
 
 		 257 aa  201  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3614  putative outer membrane protein  44.44 
 
 		 235 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  38.2 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  38.46 
 
 		 255 aa  123  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  34.98 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  36.43 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  36.84 
 
 		 240 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  34.72 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  34.96 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  35.39 
 
 		 997 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  36.07 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.67 
 
 		 236 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  37.92 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  36.36 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  35.86 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  35.21 
 
 		 251 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  31.52 
 
 		 570 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  31.25 
 
 		 566 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  37.45 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  36.09 
 
 		 241 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  33.47 
 
 		 453 aa  92.8  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7235  putative outer membrane protein  32.26 
 
 		 193 aa  92  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1666  OmpA-like transmembrane region  33.61 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  30.52 
 
 		 561 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  32.49 
 
 		 454 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  37 
 
 		 243 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  33.76 
 
 		 258 aa  89.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  33.19 
 
 		 449 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  31.11 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  31.76 
 
 		 570 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  32.68 
 
 		 447 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  33.71 
 
 		 452 aa  85.9  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  30.54 
 
 		 562 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0901  outer membrane autotransporter  33.06 
 
 		 638 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  31.64 
 
 		 578 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  31.8 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  32.76 
 
 		 449 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  30.24 
 
 		 559 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1337  putative outer membrane protein  33.48 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  31.47 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  30.14 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  31.88 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  33.02 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  30.4 
 
 		 652 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  31.88 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1013  Outer membrane autotransporter barrel  32.23 
 
 		 645 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  31.25 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  34.11 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3979  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.96 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  36.11 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  32.56 
 
 		 692 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  31.76 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  28.69 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  30.74 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  30 
 
 		 689 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  31.6 
 
 		 661 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.24 
 
 		 207 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  34.29 
 
 		 206 aa  67  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  28.72 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0329  carbohydrate-selective porin OprB  32.37 
 
 		 674 aa  65.5  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  34.29 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  27.76 
 
 		 693 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6718  hypothetical protein  38.24 
 
 		 550 aa  62.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  29.74 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  30.83 
 
 		 708 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  34.52 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  28.57 
 
 		 710 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  29.58 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.65 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  30.28 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  27.31 
 
 		 577 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  27.12 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  27.3 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  26.43 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  26.95 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  28.04 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000209958  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  33.16 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  26.45 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  30.64 
 
 		 662 aa  55.5  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  28.31 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  29.66 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  27.76 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  26.49 
 
 		 571 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  29.31 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  28.72 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1454  hypothetical protein  26.78 
 
 		 665 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3415  putative outer membrane protein of unknown function  25.32 
 
 		 680 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  28.72 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  26.83 
 
 		 285 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>