137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2763 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2763  putative outer-membrane protein precursor  100 
 
 		 251 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1567  putative outer-membrane protein precursor  56.98 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2080  putative outer-membrane protein precursor  54.3 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.366829  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  53.7 
 
 		 246 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  51.18 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  50.59 
 
 		 243 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  48.44 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  50.79 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1543  putative outer-membrane protein  48.9 
 
 		 258 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  47.22 
 
 		 247 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4376  putative outer-membrane protein  48.67 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36541  normal  0.0609964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4525  putative outer-membrane protein  48.47 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3614  putative outer membrane protein  39.46 
 
 		 235 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  31.74 
 
 		 255 aa  101  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  38.61 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  33.88 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  36.12 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  32.35 
 
 		 566 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  32.81 
 
 		 570 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  35.36 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  34.52 
 
 		 447 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  34.1 
 
 		 452 aa  89  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  35.14 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  33.64 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.41 
 
 		 236 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  36.6 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  31.76 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  33.05 
 
 		 997 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  32.95 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  31.73 
 
 		 570 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  33.02 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  31.05 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  33.33 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  33.59 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  34.63 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  31.89 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  33.07 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  31.66 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  35.2 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  31.85 
 
 		 692 aa  72.8  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  33.47 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  32.63 
 
 		 561 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  30.43 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.61 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  32.77 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  32.21 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  31.6 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  33.72 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  28.79 
 
 		 562 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7235  putative outer membrane protein  30.19 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  31.07 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  29.03 
 
 		 578 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  29.1 
 
 		 559 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  29.63 
 
 		 689 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  29.72 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  27.78 
 
 		 652 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1666  OmpA-like transmembrane region  34.05 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  30.13 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  30.41 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  30 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000209958  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  29.18 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1908  hypothetical protein  31.58 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.807781  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1337  putative outer membrane protein  35.04 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  38.1 
 
 		 204 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  32.37 
 
 		 661 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0329  carbohydrate-selective porin OprB  30.93 
 
 		 674 aa  55.8  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  30.17 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.43 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  28.24 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  28.26 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  28.69 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  33.81 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  30.14 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  30.86 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  35.68 
 
 		 710 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  27.98 
 
 		 274 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0901  outer membrane autotransporter  29.06 
 
 		 638 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2010  carbohydrate-selective porin OprB  26.03 
 
 		 703 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.35 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5381  outer membrane insertion C-terminal signal  29.95 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0409917  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  27.52 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  34.91 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  31.05 
 
 		 288 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.57 
 
 		 207 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  30.22 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  26.74 
 
 		 261 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2286  Carbohydrate-selective porin OprB  26.32 
 
 		 703 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.725177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.27 
 
 		 207 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2139  hypothetical protein  27.57 
 
 		 197 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.811527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  32.26 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  28.29 
 
 		 693 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1574  hypothetical protein  28.44 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646728  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  26.67 
 
 		 571 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  33.33 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  26.59 
 
 		 577 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  28.34 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  30.19 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1552  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  31.43 
 
 		 598 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0187168  normal  0.160619 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0583  hypothetical exported membrane spanning protein  27.06 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0248013  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  28.2 
 
 		 296 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>