200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0329 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0329  carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 674 aa  1358    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  63.74 
 
 		 661 aa  799    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  77.23 
 
 		 692 aa  1011    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1552  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  54.83 
 
 		 598 aa  668    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0187168  normal  0.160619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  62.71 
 
 		 689 aa  812    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  64.34 
 
 		 662 aa  830    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  47.34 
 
 		 710 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3415  putative outer membrane protein of unknown function  42.02 
 
 		 680 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  40.54 
 
 		 693 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3564  carbohydrate-selective porin OprB  41.88 
 
 		 724 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4249  Carbohydrate-selective porin OprB  40.77 
 
 		 670 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  41.42 
 
 		 708 aa  428  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1454  hypothetical protein  39.18 
 
 		 665 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2010  carbohydrate-selective porin OprB  41.35 
 
 		 703 aa  405  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2286  Carbohydrate-selective porin OprB  40.97 
 
 		 703 aa  398  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.725177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1972  Carbohydrate-selective porin OprB  40.42 
 
 		 703 aa  389  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0983998 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4992  Carbohydrate-selective porin OprB  46.03 
 
 		 498 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000230615  hitchhiker  0.00966153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2536  Carbohydrate-selective porin OprB  45.56 
 
 		 498 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.761533 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1131  Carbohydrate-selective porin OprB  46.21 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1039  Carbohydrate-selective porin OprB  45.45 
 
 		 462 aa  365  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.661938 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1195  hypothetical protein  46 
 
 		 501 aa  357  5e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.282348  normal  0.538855 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0352  carbohydrate-selective porin OprB  42.08 
 
 		 492 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1331  carbohydrate-selective porin OprB  41.29 
 
 		 494 aa  331  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2951  Carbohydrate-selective porin OprB  41.89 
 
 		 482 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1665  Carbohydrate-selective porin OprB  41.89 
 
 		 482 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3545  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  43.58 
 
 		 437 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.339839 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1590  Carbohydrate-selective porin OprB  41.4 
 
 		 476 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3166  Carbohydrate-selective porin OprB  39.63 
 
 		 482 aa  318  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  hitchhiker  0.000000000149961 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0411  hypothetical protein  40.14 
 
 		 499 aa  316  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6797  Carbohydrate-selective porin OprB  38.28 
 
 		 458 aa  289  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4280  carbohydrate-selective porin OprB  40.76 
 
 		 478 aa  276  6e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0703  carbohydrate-selective porin OprB  35.87 
 
 		 471 aa  272  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0647  Carbohydrate-selective porin OprB  36.88 
 
 		 472 aa  268  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2120  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  37.61 
 
 		 490 aa  262  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1395  Carbohydrate-selective porin OprB  29.36 
 
 		 471 aa  182  2.9999999999999997e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.567539  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0794  Carbohydrate-selective porin OprB  29.36 
 
 		 473 aa  179  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000421873  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  30.41 
 
 		 232 aa  101  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  35.38 
 
 		 997 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  31.43 
 
 		 240 aa  98.2  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  33.05 
 
 		 225 aa  97.8  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  32.24 
 
 		 240 aa  95.9  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  34.18 
 
 		 236 aa  95.1  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  32.08 
 
 		 559 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  34.45 
 
 		 452 aa  90.5  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.38 
 
 		 236 aa  89.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  34.33 
 
 		 207 aa  88.6  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  32.02 
 
 		 562 aa  87.4  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  32.08 
 
 		 240 aa  87.4  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  36.4 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  34.38 
 
 		 255 aa  86.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  30.96 
 
 		 561 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  34.04 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  35.33 
 
 		 207 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  33.33 
 
 		 237 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  35.86 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  31.08 
 
 		 570 aa  84  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  28.52 
 
 		 261 aa  83.6  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  33.67 
 
 		 207 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  33.05 
 
 		 236 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  33.66 
 
 		 207 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.29 
 
 		 243 aa  82.4  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  32.04 
 
 		 237 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.03 
 
 		 206 aa  82  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0429  putative 31 kDa outer-membrane immunogenic protein precursor  33.18 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.22814  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  32 
 
 		 230 aa  80.5  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  31.45 
 
 		 254 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  28.72 
 
 		 566 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  32 
 
 		 230 aa  80.5  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.25 
 
 		 207 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  32.41 
 
 		 246 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  30.65 
 
 		 237 aa  78.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  34.38 
 
 		 570 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  33.65 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  32.95 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  30.71 
 
 		 571 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  30.88 
 
 		 248 aa  76.6  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  31.8 
 
 		 243 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  29.57 
 
 		 251 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  31.51 
 
 		 206 aa  76.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  31.63 
 
 		 244 aa  76.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  31.86 
 
 		 238 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  32.68 
 
 		 243 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  28.44 
 
 		 250 aa  75.5  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  33.76 
 
 		 578 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  32.09 
 
 		 241 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  31.28 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  36.76 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  32.14 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  32.87 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  28.95 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  32.21 
 
 		 212 aa  73.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  32.29 
 
 		 228 aa  73.6  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  28.63 
 
 		 241 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  33.65 
 
 		 239 aa  72.8  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.84 
 
 		 206 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  30.36 
 
 		 449 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  32.04 
 
 		 248 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  27.39 
 
 		 228 aa  72.4  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  31.47 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  29.32 
 
 		 577 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>