205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0971 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  100 
 
 		 236 aa  475  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  72.57 
 
 		 228 aa  332  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  65.82 
 
 		 228 aa  285  5e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  67.49 
 
 		 229 aa  285  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  65.82 
 
 		 228 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  57.14 
 
 		 230 aa  275  4e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  57.14 
 
 		 230 aa  275  4e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  57.98 
 
 		 229 aa  248  8e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  37.58 
 
 		 300 aa  171  9e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  41.95 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  38.52 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  38.14 
 
 		 213 aa  149  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  36.86 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  37.25 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  37.25 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  36.67 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  40.1 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1213  omp25/ropB family outer membrane protein  31.03 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000007665  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  34.02 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1215  omp25/ropB family outer membrane protein  32.75 
 
 		 281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  9.29798e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  35.05 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  32.57 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  36.65 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  33.6 
 
 		 255 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  34.03 
 
 		 204 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  34.73 
 
 		 205 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  35.45 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  34 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  34.85 
 
 		 207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  32.56 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  31.47 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  35.04 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  31.78 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  33.33 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  32.38 
 
 		 283 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  36.62 
 
 		 211 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  34.08 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2979  outer membrane protein  36.55 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  33.81 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1973  OmpA-like transmembrane region  36.94 
 
 		 216 aa  99.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  32.74 
 
 		 207 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  35.9 
 
 		 211 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  31.28 
 
 		 206 aa  98.2  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.94 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  31.82 
 
 		 452 aa  96.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  36.89 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0784  porin  34.6 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.0786165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  33.03 
 
 		 689 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  31.5 
 
 		 207 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  30 
 
 		 710 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  36.13 
 
 		 215 aa  89.7  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  30.88 
 
 		 283 aa  89  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  32.51 
 
 		 237 aa  89  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  29.96 
 
 		 447 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  30.4 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  31.84 
 
 		 225 aa  85.9  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  35.75 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  30.25 
 
 		 692 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3564  carbohydrate-selective porin OprB  28.46 
 
 		 724 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  29.51 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  29.63 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  31.58 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  30.04 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  27.43 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  28.63 
 
 		 693 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  28.22 
 
 		 661 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  28.06 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  31.65 
 
 		 997 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  30.37 
 
 		 566 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  30.69 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  28.77 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  28.7 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  25.87 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  29.02 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  29.54 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  28.03 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  29.54 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  28.63 
 
 		 570 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  27.62 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  27.75 
 
 		 652 aa  72.4  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  28.69 
 
 		 255 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  27.1 
 
 		 238 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0901  outer membrane autotransporter  28.12 
 
 		 638 aa  71.6  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  25.42 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0284  putative outer membrane protein  29.73 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1013  Outer membrane autotransporter barrel  25.55 
 
 		 645 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  27.89 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0429  putative 31 kDa outer-membrane immunogenic protein precursor  29.57 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.22814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  24.37 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4249  Carbohydrate-selective porin OprB  29.28 
 
 		 670 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  24.58 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  27.38 
 
 		 708 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  23.53 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  30.92 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  34.91 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  29.36 
 
 		 578 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  28.11 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0849  putative outer membrane protein  31.78 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>