178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0819 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0819  porin  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  88.29 
 
 		 205 aa  347  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  34.35 
 
 		 230 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  34.35 
 
 		 230 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  34.76 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  32.35 
 
 		 236 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  37.26 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  35.34 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  36.74 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  36.44 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  36.28 
 
 		 228 aa  111  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  36.18 
 
 		 207 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  35.9 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  37.63 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0784  porin  38.03 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.0786165 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  31.17 
 
 		 244 aa  102  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  37.13 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  38.71 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  33.88 
 
 		 254 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  32.56 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  35.05 
 
 		 207 aa  94.7  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  32.23 
 
 		 255 aa  92.8  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  36.87 
 
 		 250 aa  92.4  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  36.13 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  35.88 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2979  outer membrane protein  35.2 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  35.29 
 
 		 206 aa  85.5  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.98 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  33.17 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  33.92 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  34.57 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  33.49 
 
 		 447 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  28.87 
 
 		 283 aa  82  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  34.08 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  29.82 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  32.14 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  32.42 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  30.54 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  34.84 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  35.54 
 
 		 452 aa  77.8  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1973  OmpA-like transmembrane region  33.17 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  28.1 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  31.05 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  29.72 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  32.37 
 
 		 662 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  28.22 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  27.93 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  29.28 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.67 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  31.6 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  34.84 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  30.7 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  28.57 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  31.61 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  31.76 
 
 		 689 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  28.28 
 
 		 708 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  28.69 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000209958  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  24.83 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1215  omp25/ropB family outer membrane protein  24.36 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  9.29798e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0429  putative 31 kDa outer-membrane immunogenic protein precursor  34.44 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.22814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  27.97 
 
 		 283 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  26.97 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1908  hypothetical protein  30.61 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.807781  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3083  putative outer membrane protein  36.99 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.186031 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  26.78 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  31.43 
 
 		 661 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  26.78 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  28.7 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  26.84 
 
 		 261 aa  64.7  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2139  hypothetical protein  32.24 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.811527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  27.62 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  31.17 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1213  omp25/ropB family outer membrane protein  24.21 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000007665  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  29.14 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  33.33 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.3 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  29 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  28.76 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  32.7 
 
 		 241 aa  62  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  32.06 
 
 		 240 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  29.19 
 
 		 237 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1284  hypothetical protein  29.38 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  30.14 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5303  porin  25.44 
 
 		 299 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  32.79 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  28.57 
 
 		 570 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  30.99 
 
 		 566 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1247  hypothetical protein  29.38 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  27.04 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  30.96 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  30.3 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  28.14 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  30.19 
 
 		 692 aa  59.3  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1699  hypothetical protein  29.28 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.013391  normal  0.0555253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  27.07 
 
 		 693 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  29.95 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5381  outer membrane insertion C-terminal signal  24.04 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0409917  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  32.56 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2010  carbohydrate-selective porin OprB  30.37 
 
 		 703 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1552  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  33.87 
 
 		 598 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0187168  normal  0.160619 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>