154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1234 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1234  porin  100 
 
 		 211 aa  423  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  96.68 
 
 		 211 aa  390  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  57.28 
 
 		 212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0784  porin  49.53 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.0786165 
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  42.01 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  40.55 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  40.18 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  36.8 
 
 		 229 aa  111  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  40.1 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  33.19 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  33.19 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  41.95 
 
 		 207 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  37.11 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  36.46 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1973  OmpA-like transmembrane region  41 
 
 		 216 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  35.4 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  34.32 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  34.32 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  36.32 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  36.22 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  36.46 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  35.9 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  37.13 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  34.04 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  36.51 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  32.13 
 
 		 240 aa  91.7  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  32.79 
 
 		 240 aa  91.7  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2979  outer membrane protein  34.15 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  35.71 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  36.15 
 
 		 452 aa  88.2  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  35.98 
 
 		 212 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  33.08 
 
 		 261 aa  85.1  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  37.37 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  33.75 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  33.96 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  29.79 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  29.96 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  36.41 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  35 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  30.57 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  34.74 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1552  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  37.58 
 
 		 598 aa  78.6  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0187168  normal  0.160619 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  31.45 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  33.5 
 
 		 449 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  34.41 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  39.35 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  28.93 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  30.13 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  35.09 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  35.75 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  33.19 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  32.99 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1908  hypothetical protein  30.23 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.807781  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  33.66 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_004310  BR1284  hypothetical protein  29.44 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  31.76 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  26.16 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1247  hypothetical protein  29.44 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  28.45 
 
 		 449 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  35.36 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  31.09 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  29.75 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  34.76 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0415  outer membrane protein  29.18 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  35.92 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  27.85 
 
 		 692 aa  65.1  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  31.05 
 
 		 241 aa  64.7  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  34.62 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2286  Carbohydrate-selective porin OprB  31.34 
 
 		 703 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.725177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  28.09 
 
 		 708 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2010  carbohydrate-selective porin OprB  31.34 
 
 		 703 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1972  Carbohydrate-selective porin OprB  32.19 
 
 		 703 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0983998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  35.2 
 
 		 245 aa  62  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  28.57 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  34.29 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  28.22 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  28.48 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  27.97 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  28.99 
 
 		 570 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  32.08 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1213  omp25/ropB family outer membrane protein  32.11 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000007665  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1215  omp25/ropB family outer membrane protein  29.71 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  9.29798e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  30.93 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  28.35 
 
 		 689 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  27.84 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  25.76 
 
 		 693 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  31.35 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3063  porin  25.24 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  29.79 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  30.23 
 
 		 710 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  25.96 
 
 		 652 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  28.39 
 
 		 566 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  30.21 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  27.46 
 
 		 662 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  33.33 
 
 		 578 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1337  putative outer membrane protein  31.34 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  27.42 
 
 		 254 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  30.39 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000209958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0429  putative 31 kDa outer-membrane immunogenic protein precursor  32.14 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.22814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>