203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0115 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  100 
 
 
230 aa  461  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  100 
 
 
230 aa  461  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  72.17 
 
 
229 aa  327  7e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  58.7 
 
 
228 aa  268  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  60.17 
 
 
228 aa  268  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  58.87 
 
 
228 aa  265  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  57.14 
 
 
236 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  58.01 
 
 
229 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  33.88 
 
 
300 aa  159  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  39.39 
 
 
213 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  38.53 
 
 
213 aa  149  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  38.1 
 
 
201 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  36.59 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  36.59 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1215  omp25/ropB family outer membrane protein  34.63 
 
 
281 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  9.29798e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  38.55 
 
 
261 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  35.92 
 
 
254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1213  omp25/ropB family outer membrane protein  33.21 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000007665  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  37.98 
 
 
255 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  35.96 
 
 
250 aa  122  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  35.54 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  35.81 
 
 
239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  38.28 
 
 
232 aa  115  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  37.7 
 
 
236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  35.41 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  30.58 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  32.82 
 
 
258 aa  111  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  32.39 
 
 
250 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  34.35 
 
 
204 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  33.91 
 
 
205 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  33.8 
 
 
207 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2979  outer membrane protein  38.99 
 
 
212 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  32.7 
 
 
248 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.8 
 
 
207 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  36.79 
 
 
237 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  33.05 
 
 
212 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  34.62 
 
 
211 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  35.12 
 
 
207 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  33.65 
 
 
211 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  29.54 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  34.38 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1973  OmpA-like transmembrane region  34.72 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  30.74 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  33.49 
 
 
207 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  31.44 
 
 
206 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.56 
 
 
207 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  30.53 
 
 
283 aa  95.1  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  33.33 
 
 
452 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  34.42 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  33.33 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.77 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  27.91 
 
 
255 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  28.88 
 
 
453 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  31.76 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  34.06 
 
 
215 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  30.51 
 
 
449 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0784  porin  33.33 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.0786165 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  30.6 
 
 
447 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  30.13 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  29.92 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  27.69 
 
 
661 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  29.96 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  28.38 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  31.96 
 
 
997 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  28.7 
 
 
689 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  29.87 
 
 
692 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  31.09 
 
 
449 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  24.8 
 
 
693 aa  78.6  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  28.28 
 
 
578 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  30.25 
 
 
710 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  30.23 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0901  outer membrane autotransporter  30.84 
 
 
638 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  30.23 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  27.05 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  29.25 
 
 
708 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  32.06 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  29.95 
 
 
242 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  29.95 
 
 
454 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3564  carbohydrate-selective porin OprB  29.27 
 
 
724 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0429  putative 31 kDa outer-membrane immunogenic protein precursor  31.12 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.22814  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1013  Outer membrane autotransporter barrel  29.36 
 
 
645 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  27.97 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  28.5 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  27.69 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1908  hypothetical protein  28.26 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.807781  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0329  carbohydrate-selective porin OprB  33.33 
 
 
674 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  28.04 
 
 
566 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  28.23 
 
 
570 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2142  porin  29.95 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  29.65 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  28.93 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  28.93 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.16 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  25.63 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  28.93 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  28.93 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0284  putative outer membrane protein  27.35 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  28.3 
 
 
652 aa  65.1  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  32.56 
 
 
276 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  28.05 
 
 
662 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>