80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0335 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  487  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  487  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  99.16 
 
 
239 aa  483  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  99.58 
 
 
239 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  98.54 
 
 
219 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  37.5 
 
 
263 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  37.21 
 
 
245 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  33.15 
 
 
223 aa  88.6  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  29.21 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3966  opacity protein and related surface antigens-like protein  28.88 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0601337 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  28.93 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  28.93 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  28.49 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  39.52 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  31.44 
 
 
280 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  29.41 
 
 
291 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  28.38 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  29.38 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  30.99 
 
 
288 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  31.55 
 
 
290 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  30 
 
 
287 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  31.45 
 
 
195 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  32.5 
 
 
287 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  28.57 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  31.62 
 
 
286 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  29.28 
 
 
237 aa  57  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  27.4 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  26.29 
 
 
297 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  27.8 
 
 
236 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  27.8 
 
 
236 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  27.04 
 
 
257 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  33.61 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  35.2 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  33.72 
 
 
283 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  34.95 
 
 
228 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  33.01 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  28.72 
 
 
181 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  26.83 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  28.72 
 
 
181 aa  53.5  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  35.8 
 
 
373 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  29.86 
 
 
282 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  34.48 
 
 
236 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  26.09 
 
 
212 aa  52.4  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  26.47 
 
 
285 aa  52  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  28.39 
 
 
229 aa  52  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  27.86 
 
 
279 aa  52  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  24.04 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  25.71 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  29.23 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  25.71 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  26.47 
 
 
285 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  26.54 
 
 
359 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  34 
 
 
190 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  31.46 
 
 
224 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  25.9 
 
 
270 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  30.83 
 
 
186 aa  49.3  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  31.09 
 
 
194 aa  48.5  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  30 
 
 
222 aa  48.5  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  25.96 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  27.64 
 
 
219 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  37.88 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  25.43 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  31.82 
 
 
250 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  26.09 
 
 
401 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  33.33 
 
 
190 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  26.83 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  24.07 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  27.14 
 
 
209 aa  45.1  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  27.12 
 
 
357 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  25.79 
 
 
274 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  28.41 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  30.72 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  37.04 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  28.98 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  25.79 
 
 
274 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  25.6 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  34 
 
 
213 aa  42.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  25 
 
 
226 aa  42.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  29.41 
 
 
228 aa  41.6  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  29.41 
 
 
228 aa  42  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>