134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2972 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2972  porin  100 
 
 		 285 aa  566  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  99.65 
 
 		 285 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2867  porin  90.88 
 
 		 285 aa  495  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  56.39 
 
 		 284 aa  278  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2142  porin  60.53 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3848  porin  55.81 
 
 		 287 aa  254  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  50.89 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  45.24 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  48.95 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  48.95 
 
 		 274 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  38.66 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4907  porin  38.1 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  38.1 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0474  porin  35.91 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  43.1 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  41.04 
 
 		 288 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  39.61 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  42.5 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  40.2 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  40.2 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  43.42 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  42.47 
 
 		 279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  38.61 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3379  porin  41.3 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  40.49 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  42.55 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118187 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  40.07 
 
 		 288 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  39.09 
 
 		 290 aa  125  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3108  porin  39.09 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0475237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2882  porin  39.09 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4335  porin  39.49 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  37.37 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3321  porin  40 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7845  porin  37.88 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190915  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4466  porin  39.37 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4355  porin  39.44 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.64859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3986  porin  39.44 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0565804  normal  0.846216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1624  porin  40.56 
 
 		 285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3299  porin  36.71 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.466189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2044  porin  39.02 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  37.01 
 
 		 583 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  36.26 
 
 		 571 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  36.68 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  30.89 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  33.85 
 
 		 577 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  28.87 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  29.58 
 
 		 240 aa  82  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  30.92 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  29.39 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  30.88 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  29.53 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  29.9 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  30.65 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000209958  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  31.93 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  34.39 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  30.28 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  27.49 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  30.98 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  32.98 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  26.95 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  30.39 
 
 		 225 aa  72  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  30.61 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  28.9 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  30.53 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  30.34 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  30.11 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  26.92 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  28.72 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  30.77 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0836  porin  34.01 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0404918  normal  0.853535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3546  porin  32.67 
 
 		 245 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  28.62 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  33.16 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  29.17 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  28.62 
 
 		 228 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  28.11 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  28.11 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  29.38 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  28.27 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  32.72 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  29.39 
 
 		 447 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  29.93 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  26.39 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  28.42 
 
 		 570 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.68 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  34.81 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  26.72 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  31.87 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  25.68 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  23.76 
 
 		 693 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.95 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  25.28 
 
 		 997 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  29.77 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  29.28 
 
 		 710 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  29.95 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  27.18 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  30.49 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  25.77 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1213  omp25/ropB family outer membrane protein  22 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000007665  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  26.59 
 
 		 207 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>