100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1543 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1543  putative outer-membrane protein  100 
 
 		 258 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  50.97 
 
 		 251 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  49.57 
 
 		 246 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4376  putative outer-membrane protein  50.42 
 
 		 260 aa  222  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36541  normal  0.0609964 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1567  putative outer-membrane protein precursor  44.79 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2763  putative outer-membrane protein precursor  49.12 
 
 		 251 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4525  putative outer-membrane protein  52.27 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  47.77 
 
 		 237 aa  211  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  46.98 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  45.41 
 
 		 241 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2080  putative outer-membrane protein precursor  45.77 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.366829  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  42.8 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3614  putative outer membrane protein  39.82 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  30.74 
 
 		 997 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  35.61 
 
 		 274 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  32.48 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  33.46 
 
 		 237 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  34.7 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  31.09 
 
 		 245 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  33.04 
 
 		 258 aa  86.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.2 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  30.98 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  32.95 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  31.78 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  32.64 
 
 		 561 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  33.47 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.64 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  30.13 
 
 		 566 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  31.18 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  31.94 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  30.43 
 
 		 689 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  29.27 
 
 		 570 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  31.09 
 
 		 559 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  28.94 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  29.55 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  31.97 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  33.82 
 
 		 661 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  32.5 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  30.14 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  31.87 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  32.57 
 
 		 447 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  28.1 
 
 		 570 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  32.55 
 
 		 453 aa  72  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  34.44 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  30.51 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  32.77 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  29.07 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  30.13 
 
 		 578 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  29.36 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  27.43 
 
 		 454 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  29.39 
 
 		 652 aa  62  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  29.36 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  29.47 
 
 		 662 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  28.32 
 
 		 449 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7235  putative outer membrane protein  29.03 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  29.72 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2286  Carbohydrate-selective porin OprB  29.49 
 
 		 703 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.725177 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  30.39 
 
 		 692 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  30.21 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  30.68 
 
 		 710 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0329  carbohydrate-selective porin OprB  32 
 
 		 674 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.69 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1666  OmpA-like transmembrane region  29.88 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  31.05 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  28.85 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  28.38 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2010  carbohydrate-selective porin OprB  28.63 
 
 		 703 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0901  outer membrane autotransporter  28.11 
 
 		 638 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  31.82 
 
 		 240 aa  52.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.24 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  31.28 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  27.09 
 
 		 207 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  26.48 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000209958  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  27.19 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  29.26 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  31.28 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  29.03 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4249  Carbohydrate-selective porin OprB  26.96 
 
 		 670 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  28.57 
 
 		 241 aa  48.9  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  28.93 
 
 		 693 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  22.89 
 
 		 577 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  27.89 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  28.46 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1972  Carbohydrate-selective porin OprB  28.28 
 
 		 703 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0983998 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1337  putative outer membrane protein  29.26 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1013  Outer membrane autotransporter barrel  24.8 
 
 		 645 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4835  porin  27.96 
 
 		 313 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  27.05 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  28.5 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2718  outer membrane protein  33.1 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.700569  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1376  putative outer membrane protein  32.86 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  25.53 
 
 		 571 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6718  hypothetical protein  30.16 
 
 		 550 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2139  hypothetical protein  29.56 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.811527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3848  porin  26.4 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  25.23 
 
 		 229 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  28.06 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  25.93 
 
 		 274 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  26.64 
 
 		 274 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  28.33 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>