181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0337 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0329  TonB-dependent receptor  90.38 
 
 
800 aa  1514    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0337  TonB-dependent receptor  100 
 
 
800 aa  1642    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770898  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2831  TonB-dependent receptor  62.1 
 
 
808 aa  1002    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372733  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1213  TonB-dependent receptor  62.39 
 
 
799 aa  1014    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0138  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  41.66 
 
 
810 aa  601  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0694219  normal  0.222818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  27.94 
 
 
859 aa  217  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  27.74 
 
 
861 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.12 
 
 
867 aa  211  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  27.37 
 
 
857 aa  207  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  28.2 
 
 
764 aa  207  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.15 
 
 
759 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  28.1 
 
 
764 aa  203  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.61 
 
 
750 aa  192  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  26.6 
 
 
755 aa  187  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3082  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25 
 
 
730 aa  186  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25355  normal  0.407735 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5431  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  27.11 
 
 
755 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4772  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.33 
 
 
769 aa  185  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784759  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5431  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.11 
 
 
755 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469015  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4838  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.91 
 
 
757 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1781  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.6 
 
 
769 aa  184  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0440  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  26.6 
 
 
764 aa  184  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0347  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  26.6 
 
 
759 aa  184  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1826  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.6 
 
 
718 aa  183  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0529347  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0824  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  26.53 
 
 
767 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.359227  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1115  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  26.6 
 
 
767 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3338  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.75 
 
 
755 aa  182  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.275973  decreased coverage  0.000566863 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2089  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  26.6 
 
 
767 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329074  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  27.22 
 
 
698 aa  182  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.87 
 
 
714 aa  180  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.55 
 
 
754 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5315  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.2 
 
 
767 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.11 
 
 
728 aa  176  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2139  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.55 
 
 
766 aa  169  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2929  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.06 
 
 
755 aa  162  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.56728  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.87 
 
 
762 aa  156  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  24.45 
 
 
739 aa  156  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  24.29 
 
 
712 aa  151  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03722  outer membrane hemin receptor signal peptide protein  24.9 
 
 
741 aa  150  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000281288  normal  0.0836882 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  24.28 
 
 
693 aa  148  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0719  TonB-dependent receptor, putative  24.35 
 
 
747 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  31.62 
 
 
862 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  31.88 
 
 
862 aa  138  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.41 
 
 
862 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  24.15 
 
 
712 aa  125  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2813  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.97 
 
 
752 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409295  normal  0.033455 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3145  TonB-dependent receptor plug  23.95 
 
 
787 aa  117  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.394815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3079  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.31 
 
 
749 aa  107  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578184  normal  0.640721 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2296  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.07 
 
 
734 aa  104  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.234344 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0460  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.09 
 
 
731 aa  99.4  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  22.85 
 
 
713 aa  99  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3271  outer membrane heme receptor  23.59 
 
 
728 aa  97.8  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403034  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0449  transferrin-binding protein A  28.76 
 
 
992 aa  88.6  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0459359  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0590  hemoglobin and hemoglobin-haptoglobin binding protein B  28.08 
 
 
998 aa  74.3  0.000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  24.93 
 
 
490 aa  69.7  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0582  heme uptake protein  24.4 
 
 
788 aa  66.2  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000461965  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 
672 aa  65.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2862  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.42 
 
 
737 aa  65.5  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0664764 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  28.02 
 
 
750 aa  65.5  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  22.3 
 
 
668 aa  65.1  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1580  TonB-dependent heme receptor  20.77 
 
 
737 aa  64.7  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05128  hypothetical protein  21.89 
 
 
458 aa  62.4  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.19 
 
 
778 aa  61.6  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1381  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.43 
 
 
739 aa  61.6  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1420  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.61 
 
 
739 aa  61.2  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.330075  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1397  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.43 
 
 
739 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2957  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.24 
 
 
739 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 
681 aa  59.7  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  22.24 
 
 
778 aa  58.9  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  26.27 
 
 
665 aa  58.9  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  26.27 
 
 
665 aa  58.9  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  26.27 
 
 
665 aa  58.9  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 
684 aa  58.9  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  27.49 
 
 
660 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  27.49 
 
 
660 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05130  hypothetical protein  26.21 
 
 
248 aa  56.2  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  27.91 
 
 
751 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  26.95 
 
 
751 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  28.02 
 
 
751 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  28.02 
 
 
751 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  26.85 
 
 
751 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 
873 aa  55.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  23.06 
 
 
687 aa  55.5  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.87 
 
 
783 aa  55.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  26.07 
 
 
653 aa  54.7  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.32 
 
 
661 aa  54.7  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1308  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.77 
 
 
737 aa  54.7  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  26.73 
 
 
666 aa  54.3  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  27.34 
 
 
746 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  27.34 
 
 
746 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  27.34 
 
 
746 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  27.34 
 
 
746 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  27.34 
 
 
746 aa  53.5  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  21.49 
 
 
649 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  22.51 
 
 
635 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  27.34 
 
 
746 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  27.34 
 
 
746 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  27.34 
 
 
746 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  25.25 
 
 
705 aa  52.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 
749 aa  53.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  27.34 
 
 
746 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>