254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05130 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05130  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  514  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  77.87 
 
 
712 aa  418  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  54.66 
 
 
713 aa  290  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  33.46 
 
 
728 aa  108  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  30.22 
 
 
857 aa  99  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2929  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.86 
 
 
755 aa  97.1  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.56728  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  30.11 
 
 
859 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  30.45 
 
 
861 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  27.38 
 
 
739 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0719  TonB-dependent receptor, putative  27.24 
 
 
747 aa  92.4  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  28.79 
 
 
698 aa  91.3  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  32.72 
 
 
764 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  31.39 
 
 
764 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  26.85 
 
 
688 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  28.12 
 
 
693 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.08 
 
 
714 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  26.46 
 
 
688 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  26.46 
 
 
688 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.88 
 
 
862 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  26.07 
 
 
688 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4772  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.1 
 
 
769 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784759  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.48 
 
 
867 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  24.88 
 
 
719 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.62 
 
 
862 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3338  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.07 
 
 
755 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.275973  decreased coverage  0.000566863 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.59 
 
 
762 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.88 
 
 
750 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  24.4 
 
 
723 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.62 
 
 
862 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.62 
 
 
759 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  27.01 
 
 
668 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  26.07 
 
 
667 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  27.44 
 
 
755 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  27.84 
 
 
712 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3079  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.31 
 
 
749 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578184  normal  0.640721 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  27.01 
 
 
668 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 
668 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5431  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  27 
 
 
755 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5431  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27 
 
 
755 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469015  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2813  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.05 
 
 
752 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409295  normal  0.033455 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4838  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27 
 
 
757 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3082  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.06 
 
 
730 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25355  normal  0.407735 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  26.56 
 
 
661 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  23.48 
 
 
725 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  23.48 
 
 
698 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3271  outer membrane heme receptor  27.02 
 
 
728 aa  65.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403034  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 
672 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0460  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.46 
 
 
731 aa  63.9  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1781  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.48 
 
 
769 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0347  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  25.48 
 
 
759 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2089  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  25.48 
 
 
767 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329074  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0824  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  25.48 
 
 
767 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.359227  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1115  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  25.48 
 
 
767 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0440  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  25.48 
 
 
764 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1826  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.48 
 
 
718 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0529347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  23.53 
 
 
710 aa  62  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03722  outer membrane hemin receptor signal peptide protein  27.82 
 
 
741 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000281288  normal  0.0836882 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  24.17 
 
 
676 aa  61.6  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  24.17 
 
 
676 aa  61.6  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5315  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.1 
 
 
767 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 
726 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  26.1 
 
 
700 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2139  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25 
 
 
766 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  25.23 
 
 
663 aa  59.3  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  25.45 
 
 
732 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  21.13 
 
 
687 aa  58.5  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 
668 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  26.49 
 
 
726 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 
627 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  28.1 
 
 
663 aa  56.2  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  23.83 
 
 
684 aa  56.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  23.81 
 
 
695 aa  56.6  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2296  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.06 
 
 
734 aa  56.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.234344 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  27.54 
 
 
666 aa  56.2  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0337  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 
800 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770898  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.01 
 
 
754 aa  55.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  28.32 
 
 
663 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  27.23 
 
 
699 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  28.14 
 
 
633 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  25 
 
 
702 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0329  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 
800 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  26.03 
 
 
653 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  26.2 
 
 
759 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  21.29 
 
 
661 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  25.12 
 
 
662 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  22.55 
 
 
753 aa  53.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 
673 aa  53.1  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 
653 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0576  catecholate siderophore receptor Fiu  27.23 
 
 
754 aa  52.8  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000714833  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  26.57 
 
 
666 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  27.06 
 
 
733 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  26.57 
 
 
666 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0582  heme uptake protein  24.14 
 
 
788 aa  52  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000461965  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  26.57 
 
 
666 aa  52  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  26.57 
 
 
666 aa  52  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1858  heme transport protein HugA  28.06 
 
 
683 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  24.02 
 
 
665 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 
649 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 
649 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  22.06 
 
 
745 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>