More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05316 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1000  TonB-dependent receptor  61.22 
 
 		 778 aa  883    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  84.34 
 
 		 772 aa  1317    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  100 
 
 		 779 aa  1582    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  47.92 
 
 		 804 aa  638    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0477  TonB-dependent receptor  61.22 
 
 		 778 aa  883    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.642633  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  60.95 
 
 		 784 aa  880    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3037  TonB-dependent receptor  61.22 
 
 		 778 aa  883    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000978239  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0146  TonB-dependent receptor  61.22 
 
 		 778 aa  883    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580852  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  61.51 
 
 		 788 aa  890    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0970  TonB-dependent receptor  61.79 
 
 		 786 aa  892    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108903  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1598  TonB-dependent receptor  61.57 
 
 		 778 aa  896    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0220938  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  46.69 
 
 		 794 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2630  TonB-dependent receptor  61.22 
 
 		 778 aa  883    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0532  hypothetical protein  61.79 
 
 		 790 aa  891    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203812  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  60.95 
 
 		 784 aa  881    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2388  TonB-dependent receptor  60.39 
 
 		 788 aa  855    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2999  TonB-dependent receptor  61.08 
 
 		 778 aa  879    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2935  TonB-dependent receptor  61.22 
 
 		 778 aa  884    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0458457  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  84.34 
 
 		 772 aa  1317    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1010  TonB-dependent receptor  61.79 
 
 		 790 aa  891    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0114301  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  40.7 
 
 		 760 aa  505  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  38.78 
 
 		 821 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  37.02 
 
 		 761 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 		 796 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0635  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 874 aa  341  2.9999999999999998e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 782 aa  341  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2882  TonB-dependent receptor protein  30.7 
 
 		 780 aa  320  5e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00344491  hitchhiker  0.00617905 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1629  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 718 aa  284  4.0000000000000003e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00166049  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 737 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 742 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 742 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 719 aa  171  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 762 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 736 aa  164  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 764 aa  156  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 		 719 aa  90.9  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 709 aa  89.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 708 aa  89.4  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 716 aa  87.4  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1412  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 399 aa  87.4  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 735 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  30.16 
 
 		 792 aa  85.1  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 642 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4255  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 720 aa  84.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  28.77 
 
 		 695 aa  82.8  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 733 aa  82  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 642 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  21.62 
 
 		 780 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5132  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 682 aa  80.5  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 709 aa  79  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  21.28 
 
 		 763 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  26.81 
 
 		 753 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 642 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 706 aa  78.2  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 642 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 642 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 706 aa  78.2  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  28.7 
 
 		 710 aa  78.2  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 638 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 775 aa  77.8  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  25.43 
 
 		 733 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 		 827 aa  76.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  23.7 
 
 		 731 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 653 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 702 aa  75.9  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 649 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 776 aa  75.5  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 733 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 714 aa  74.3  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  24.68 
 
 		 768 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  28.98 
 
 		 725 aa  73.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 674 aa  73.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 731 aa  73.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.93 
 
 		 713 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  24.64 
 
 		 733 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.93 
 
 		 713 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2433  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 754 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.747625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  23.02 
 
 		 760 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 733 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 715 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5315  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.03 
 
 		 767 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  28.52 
 
 		 698 aa  71.6  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 635 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4838  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.33 
 
 		 757 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  24.66 
 
 		 788 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 731 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5431  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  26.09 
 
 		 755 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5431  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.09 
 
 		 755 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469015  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 		 751 aa  70.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 693 aa  70.1  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4786  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 712 aa  70.1  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.789588  normal  0.608467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 744 aa  69.3  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 731 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 634 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  24.51 
 
 		 807 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 		 703 aa  69.3  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  26 
 
 		 755 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 957 aa  68.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  24.11 
 
 		 641 aa  68.2  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 801 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>