More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1598 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  48.46 
 
 
804 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2935  TonB-dependent receptor  95.81 
 
 
778 aa  1417    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0458457  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  59.81 
 
 
772 aa  937    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  61.57 
 
 
779 aa  916    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0477  TonB-dependent receptor  95.41 
 
 
778 aa  1412    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.642633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3037  TonB-dependent receptor  95.54 
 
 
778 aa  1414    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000978239  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  80.91 
 
 
788 aa  1201    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2630  TonB-dependent receptor  95.41 
 
 
778 aa  1412    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  80.19 
 
 
784 aa  1191    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0146  TonB-dependent receptor  95.41 
 
 
778 aa  1412    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1598  TonB-dependent receptor  100 
 
 
778 aa  1578    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0220938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0970  TonB-dependent receptor  81.29 
 
 
786 aa  1199    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108903  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  46.75 
 
 
794 aa  654    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1000  TonB-dependent receptor  95.41 
 
 
778 aa  1412    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  59.81 
 
 
772 aa  937    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0532  hypothetical protein  81.43 
 
 
790 aa  1203    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203812  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  78.78 
 
 
784 aa  1202    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1010  TonB-dependent receptor  81.43 
 
 
790 aa  1203    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0114301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2388  TonB-dependent receptor  80.61 
 
 
788 aa  1174    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2999  TonB-dependent receptor  95.54 
 
 
778 aa  1413    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  42.38 
 
 
760 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  37.21 
 
 
821 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  35.57 
 
 
761 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 
796 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
782 aa  368  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2882  TonB-dependent receptor protein  32.61 
 
 
780 aa  364  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00344491  hitchhiker  0.00617905 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0635  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 
874 aa  355  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1629  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 
718 aa  328  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00166049  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  29 
 
 
737 aa  211  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 
742 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 
762 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 
736 aa  194  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 
719 aa  184  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 
764 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 
742 aa  154  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 
627 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1826  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.64 
 
 
718 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0529347  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 
624 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0824  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  23.64 
 
 
767 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.359227  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 
714 aa  82.4  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2089  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  23.64 
 
 
767 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329074  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1115  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  23.64 
 
 
767 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0440  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  23.64 
 
 
764 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1781  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.51 
 
 
769 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0347  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  23.51 
 
 
759 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 
792 aa  80.9  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 
698 aa  78.2  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 
698 aa  78.2  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 
698 aa  78.2  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 
719 aa  77  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 
836 aa  77.4  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 
733 aa  77  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  21.42 
 
 
696 aa  75.9  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 
815 aa  75.5  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.1 
 
 
653 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  23.55 
 
 
635 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  22.82 
 
 
695 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  26.95 
 
 
621 aa  72  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 
634 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 
716 aa  70.9  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 
732 aa  69.7  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 
709 aa  69.3  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 
655 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0095  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 
823 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5315  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.59 
 
 
767 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  31.91 
 
 
755 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  23.56 
 
 
788 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  30.91 
 
 
639 aa  67.8  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4838  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.78 
 
 
757 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.32 
 
 
656 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5431  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  27.78 
 
 
755 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 
733 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  25.86 
 
 
693 aa  66.6  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5431  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.78 
 
 
755 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469015  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 
697 aa  65.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  22.48 
 
 
696 aa  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  22.48 
 
 
696 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 
706 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 
706 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 
735 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1983  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 
727 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454223  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 
733 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  24.91 
 
 
695 aa  65.1  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3338  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.92 
 
 
755 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.275973  decreased coverage  0.000566863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  24.01 
 
 
724 aa  65.1  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 
680 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  28.93 
 
 
686 aa  64.7  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  24.85 
 
 
741 aa  64.7  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.37 
 
 
669 aa  64.7  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 
702 aa  64.3  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 
674 aa  64.3  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  23.59 
 
 
713 aa  64.3  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 
742 aa  64.3  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 
742 aa  64.3  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  21.81 
 
 
663 aa  63.9  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  29.12 
 
 
662 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 
642 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2558  TonB-dependent siderophore receptor  23.75 
 
 
760 aa  63.9  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.897783  normal  0.0361628 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 
642 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 
642 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>