More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4626 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2999  TonB-dependent receptor  47.06 
 
 		 778 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  49.18 
 
 		 772 aa  677    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  46.77 
 
 		 779 aa  661    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0477  TonB-dependent receptor  47.19 
 
 		 778 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.642633  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  48.7 
 
 		 784 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3037  TonB-dependent receptor  47.06 
 
 		 778 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000978239  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  48.08 
 
 		 788 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 804 aa  1644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2630  TonB-dependent receptor  47.19 
 
 		 778 aa  647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0146  TonB-dependent receptor  47.19 
 
 		 778 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1598  TonB-dependent receptor  48.46 
 
 		 778 aa  641    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0220938  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  89.95 
 
 		 794 aa  1448    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1000  TonB-dependent receptor  47.19 
 
 		 778 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0532  hypothetical protein  49.04 
 
 		 790 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203812  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  48.83 
 
 		 784 aa  665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2935  TonB-dependent receptor  47.19 
 
 		 778 aa  646    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0458457  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  49.18 
 
 		 772 aa  677    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1010  TonB-dependent receptor  49.04 
 
 		 790 aa  662    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0114301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0970  TonB-dependent receptor  49.32 
 
 		 786 aa  665    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108903  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2388  TonB-dependent receptor  48.9 
 
 		 788 aa  635  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  40.94 
 
 		 760 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  41.08 
 
 		 821 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  36.57 
 
 		 761 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  35.27 
 
 		 796 aa  423  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  33.5 
 
 		 782 aa  382  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2882  TonB-dependent receptor protein  31.86 
 
 		 780 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00344491  hitchhiker  0.00617905 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0635  TonB-dependent receptor  33.91 
 
 		 874 aa  360  7e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1629  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 718 aa  334  4e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00166049  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 742 aa  204  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 737 aa  198  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 719 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 762 aa  183  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 742 aa  170  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 736 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 764 aa  161  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 714 aa  94.4  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 702 aa  88.6  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 796 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  22.22 
 
 		 746 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 		 796 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 		 796 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.42 
 
 		 706 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 705 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 743 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  21.93 
 
 		 746 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  26.17 
 
 		 696 aa  82  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  26.17 
 
 		 696 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.17 
 
 		 695 aa  80.9  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 635 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  22.62 
 
 		 638 aa  80.1  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 		 796 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 653 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 795 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 795 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 709 aa  77  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 733 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  22.65 
 
 		 733 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 698 aa  75.1  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 698 aa  75.1  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 698 aa  75.1  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.2 
 
 		 656 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  26.04 
 
 		 744 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 716 aa  74.7  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  25.69 
 
 		 744 aa  74.3  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  27.13 
 
 		 744 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  28.66 
 
 		 778 aa  73.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  22.72 
 
 		 706 aa  72.8  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 657 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 		 792 aa  72.4  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  25 
 
 		 746 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4255  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 720 aa  71.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.42 
 
 		 713 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  22.62 
 
 		 648 aa  71.6  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.17 
 
 		 713 aa  71.2  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  24.25 
 
 		 656 aa  70.5  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 613 aa  70.5  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 733 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  27.82 
 
 		 689 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  27.7 
 
 		 807 aa  70.1  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  25 
 
 		 653 aa  69.7  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 678 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 733 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 757 aa  68.6  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 732 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 702 aa  68.2  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1662  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 686 aa  67.8  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.917445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 766 aa  67.4  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  26.74 
 
 		 697 aa  67.4  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 733 aa  67  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 781 aa  67  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  22.69 
 
 		 749 aa  67  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 708 aa  67.4  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 863 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 828 aa  66.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 719 aa  66.6  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 721 aa  66.2  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 		 713 aa  66.6  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 710 aa  65.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  24.17 
 
 		 665 aa  65.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 734 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>