More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2388 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2935  TonB-dependent receptor  79.16 
 
 
778 aa  1198    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0458457  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  60.39 
 
 
779 aa  899    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  88.38 
 
 
784 aa  1357    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0477  TonB-dependent receptor  79.03 
 
 
778 aa  1196    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.642633  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  49.3 
 
 
804 aa  653    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1000  TonB-dependent receptor  79.03 
 
 
778 aa  1196    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3037  TonB-dependent receptor  78.89 
 
 
778 aa  1194    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000978239  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  89.09 
 
 
788 aa  1369    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  59.34 
 
 
772 aa  914    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1598  TonB-dependent receptor  80.61 
 
 
778 aa  1198    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0220938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0970  TonB-dependent receptor  87.86 
 
 
786 aa  1345    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108903  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  48.01 
 
 
794 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0532  hypothetical protein  87.97 
 
 
790 aa  1345    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203812  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  59.34 
 
 
772 aa  914    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2630  TonB-dependent receptor  79.03 
 
 
778 aa  1196    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2999  TonB-dependent receptor  78.89 
 
 
778 aa  1193    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0146  TonB-dependent receptor  79.03 
 
 
778 aa  1196    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580852  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  88.51 
 
 
784 aa  1361    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1010  TonB-dependent receptor  87.97 
 
 
790 aa  1345    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0114301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2388  TonB-dependent receptor  100 
 
 
788 aa  1589    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  41.78 
 
 
760 aa  536  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  38.35 
 
 
821 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 
761 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 
796 aa  372  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 
782 aa  350  7e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2882  TonB-dependent receptor protein  31.71 
 
 
780 aa  345  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00344491  hitchhiker  0.00617905 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0635  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 
874 aa  337  5.999999999999999e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1629  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 
718 aa  310  8e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00166049  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 
742 aa  203  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 
737 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 
736 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 
719 aa  183  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 
762 aa  177  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 
742 aa  171  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 
764 aa  162  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 
792 aa  87.4  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 
714 aa  85.1  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 
709 aa  84  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.39 
 
 
861 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.03 
 
 
859 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 
716 aa  78.6  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  24.51 
 
 
635 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.24 
 
 
653 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  24.8 
 
 
680 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.07 
 
 
867 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  23.59 
 
 
696 aa  75.1  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  21.64 
 
 
695 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.38 
 
 
656 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  26.69 
 
 
693 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 
698 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 
698 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.43 
 
 
862 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 
735 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.96 
 
 
669 aa  73.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  22.59 
 
 
616 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 
698 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2089  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  24.2 
 
 
767 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329074  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0824  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  24.2 
 
 
767 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.359227  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1115  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  24.2 
 
 
767 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1826  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.76 
 
 
718 aa  72  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0529347  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 
801 aa  72  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.94 
 
 
762 aa  71.6  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 
733 aa  71.6  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 
642 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.78 
 
 
685 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  24.34 
 
 
641 aa  70.5  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0440  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  24.4 
 
 
764 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5315  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.29 
 
 
767 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  28.85 
 
 
755 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 
627 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  22.64 
 
 
696 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4838  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.69 
 
 
757 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 
642 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  22.64 
 
 
696 aa  70.1  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 
642 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 
642 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  24.56 
 
 
821 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 
777 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5431  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  28.69 
 
 
755 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5431  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.69 
 
 
755 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469015  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.48 
 
 
685 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.48 
 
 
685 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 
731 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  24.2 
 
 
857 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  24.48 
 
 
685 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0347  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  24.26 
 
 
759 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1781  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.26 
 
 
769 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 
674 aa  68.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.48 
 
 
685 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 
731 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2433  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 
754 aa  68.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.747625 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 
629 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.63 
 
 
685 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  24.33 
 
 
788 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 
701 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  22.69 
 
 
663 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 
757 aa  68.2  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 
642 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 
715 aa  68.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 
701 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>