268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1838 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 796 aa  1630    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  51.65 
 
 		 782 aa  739    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  45.63 
 
 		 821 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  38.49 
 
 		 760 aa  452  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  35.54 
 
 		 794 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  34.9 
 
 		 804 aa  412  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  35.2 
 
 		 779 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 788 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2935  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 778 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0458457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2999  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 778 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0477  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 778 aa  379  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.642633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3037  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 778 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000978239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2630  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 778 aa  379  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1000  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 778 aa  379  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0146  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 778 aa  379  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580852  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 772 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1598  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 778 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0220938  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 772 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0532  hypothetical protein  32.16 
 
 		 790 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203812  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0970  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 786 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108903  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1010  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 790 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0114301  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 784 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 784 aa  365  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2388  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 788 aa  363  6e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 761 aa  349  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2882  TonB-dependent receptor protein  29.5 
 
 		 780 aa  315  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00344491  hitchhiker  0.00617905 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0635  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 874 aa  296  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1629  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 718 aa  228  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00166049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 762 aa  181  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 742 aa  147  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 742 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 737 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 719 aa  142  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 736 aa  140  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 764 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  23.5 
 
 		 652 aa  80.9  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.12 
 
 		 712 aa  75.1  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.51 
 
 		 695 aa  74.3  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1412  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 399 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.84 
 
 		 696 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.84 
 
 		 696 aa  70.1  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  27.19 
 
 		 807 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 801 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4255  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 720 aa  68.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  21.94 
 
 		 777 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  21.32 
 
 		 744 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  23.81 
 
 		 788 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1273  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 665 aa  65.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227492  normal  0.0101206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  21.52 
 
 		 744 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 680 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  21.04 
 
 		 744 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 709 aa  64.3  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3667  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 624 aa  63.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 836 aa  63.5  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  21.32 
 
 		 777 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  21.32 
 
 		 777 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 742 aa  62.4  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  38.46 
 
 		 652 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 652 aa  62.8  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  20.79 
 
 		 828 aa  61.2  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  21.17 
 
 		 698 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  21.17 
 
 		 698 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 775 aa  60.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  21.93 
 
 		 746 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  21.17 
 
 		 698 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  21.17 
 
 		 724 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 670 aa  58.9  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  38.98 
 
 		 671 aa  58.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  38.98 
 
 		 699 aa  58.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  21.79 
 
 		 746 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  22 
 
 		 702 aa  58.2  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0993  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 735 aa  57.8  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0663099  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  20.83 
 
 		 724 aa  57.4  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 815 aa  57.4  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  21.05 
 
 		 724 aa  57.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  21.05 
 
 		 724 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 705 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 688 aa  57  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  29.02 
 
 		 784 aa  57  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5132  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 682 aa  57.4  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 720 aa  56.2  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  25.32 
 
 		 615 aa  55.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1375  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 681 aa  56.2  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 726 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 649 aa  55.5  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  24.44 
 
 		 691 aa  54.7  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  31.93 
 
 		 822 aa  54.3  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 805 aa  54.3  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 700 aa  54.3  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  25.28 
 
 		 633 aa  53.5  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 780 aa  53.5  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  24.11 
 
 		 732 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.75 
 
 		 689 aa  53.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 649 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2885  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 673 aa  53.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.159782 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  20.68 
 
 		 751 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 680 aa  53.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  20.68 
 
 		 751 aa  52.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  22.96 
 
 		 726 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 828 aa  52.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>