111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1375 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1375  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 681 aa  1322    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2885  TonB-dependent receptor  48.25 
 
 		 673 aa  458  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.159782 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5132  TonB-dependent receptor  43.01 
 
 		 682 aa  360  5e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1662  TonB-dependent receptor  40.92 
 
 		 686 aa  331  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.917445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1273  TonB-dependent receptor  36.96 
 
 		 665 aa  306  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227492  normal  0.0101206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4255  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 720 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2433  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 754 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.747625 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0772  TonB-dependent receptor plug  39.23 
 
 		 800 aa  150  9e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1412  TonB-dependent receptor  33.58 
 
 		 399 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 618 aa  85.1  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 742 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 742 aa  77.8  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 737 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 634 aa  75.5  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 736 aa  75.1  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0676  TonB-dependent receptor  20.11 
 
 		 732 aa  72.8  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.218893  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 632 aa  66.2  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 719 aa  62.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 642 aa  62  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 794 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 804 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  24.54 
 
 		 639 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 762 aa  59.7  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2882  TonB-dependent receptor protein  26.05 
 
 		 780 aa  58.9  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00344491  hitchhiker  0.00617905 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  23.33 
 
 		 634 aa  58.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 821 aa  56.6  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 796 aa  56.2  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  22.33 
 
 		 663 aa  55.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 611 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  28.38 
 
 		 611 aa  54.7  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 760 aa  54.7  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 664 aa  54.7  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 641 aa  54.7  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  26.21 
 
 		 779 aa  54.3  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  41.77 
 
 		 697 aa  54.3  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 635 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  41.25 
 
 		 620 aa  53.9  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 746 aa  53.9  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 782 aa  53.5  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 653 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  26.24 
 
 		 655 aa  53.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.21 
 
 		 631 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 709 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.21 
 
 		 631 aa  52.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  22.2 
 
 		 715 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 698 aa  51.6  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 641 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.81 
 
 		 728 aa  50.8  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  25.81 
 
 		 713 aa  50.4  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 818 aa  50.8  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 682 aa  50.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1503  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 643 aa  50.4  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 743 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 613 aa  49.3  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 638 aa  49.3  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 707 aa  48.9  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 654 aa  48.9  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  31.43 
 
 		 647 aa  48.5  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 		 728 aa  48.5  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 772 aa  48.5  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 799 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 772 aa  48.5  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 640 aa  48.1  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 651 aa  47.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 690 aa  48.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  21.89 
 
 		 625 aa  47.8  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 656 aa  47.8  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 735 aa  47.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  26.34 
 
 		 614 aa  47.4  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  29.66 
 
 		 650 aa  47.4  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 833 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.14 
 
 		 657 aa  47  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 799 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 621 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 688 aa  46.2  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 764 aa  46.2  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 715 aa  46.2  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 799 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 638 aa  46.2  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 815 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2071  TonB-dependent receptor  35.8 
 
 		 629 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00162344  hitchhiker  0.000156466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 711 aa  45.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 658 aa  45.8  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 702 aa  45.8  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  24.26 
 
 		 628 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  22.67 
 
 		 634 aa  45.8  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1769  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 985 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  30.33 
 
 		 671 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  26.14 
 
 		 712 aa  45.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2526  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 620 aa  45.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.995023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 710 aa  45.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  23.83 
 
 		 730 aa  45.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 822 aa  45.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 721 aa  44.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 699 aa  44.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  26.29 
 
 		 664 aa  44.7  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  28.95 
 
 		 675 aa  44.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  20.76 
 
 		 705 aa  44.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 784 aa  44.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  24.12 
 
 		 612 aa  44.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>