More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0772 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0772  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 800 aa  1576    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1273  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 665 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227492  normal  0.0101206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2433  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 754 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.747625 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1412  TonB-dependent receptor  33.99 
 
 		 399 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4255  TonB-dependent receptor  35.78 
 
 		 720 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2885  TonB-dependent receptor  36.02 
 
 		 673 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.159782 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1375  TonB-dependent receptor  39.23 
 
 		 681 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1662  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 686 aa  107  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.917445  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 719 aa  106  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5132  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 682 aa  99.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  30.96 
 
 		 713 aa  81.3  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0676  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 732 aa  80.9  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.218893  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 764 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 707 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 688 aa  73.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 616 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 736 aa  71.2  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  32.87 
 
 		 742 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 737 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 634 aa  67.4  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  25.86 
 
 		 666 aa  67.4  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  34.38 
 
 		 639 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 688 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 621 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 742 aa  65.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 653 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  33.33 
 
 		 1023 aa  65.1  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 762 aa  64.7  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 679 aa  64.7  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  25.84 
 
 		 706 aa  63.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  27.78 
 
 		 718 aa  63.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 647 aa  62.4  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 602 aa  62  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 614 aa  62  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  29.74 
 
 		 623 aa  61.6  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 714 aa  61.6  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  21.42 
 
 		 781 aa  61.6  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  26 
 
 		 668 aa  61.2  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 684 aa  61.6  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 626 aa  61.2  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  28.3 
 
 		 642 aa  61.2  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 626 aa  61.2  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 747 aa  61.2  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1382  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 655 aa  60.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00890122  normal  0.0713693 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  27.46 
 
 		 614 aa  60.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 629 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 638 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  29.25 
 
 		 518 aa  60.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 698 aa  60.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 784 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  28.57 
 
 		 687 aa  60.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  32.05 
 
 		 680 aa  60.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 784 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 642 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  28.05 
 
 		 638 aa  60.1  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 828 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 638 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  29.33 
 
 		 670 aa  60.1  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3462  TonB-dependent receptor  44.83 
 
 		 668 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 642 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  28.57 
 
 		 677 aa  59.7  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 642 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 642 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 627 aa  59.7  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 642 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 643 aa  59.3  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.8 
 
 		 685 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.8 
 
 		 685 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  25.27 
 
 		 821 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  27.14 
 
 		 662 aa  59.3  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 828 aa  59.3  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.8 
 
 		 685 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 694 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.8 
 
 		 685 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 836 aa  59.3  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.8 
 
 		 685 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  50 
 
 		 664 aa  58.9  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  50 
 
 		 666 aa  58.9  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  25.75 
 
 		 685 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2675  TonB-dependent receptor  38.18 
 
 		 667 aa  58.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 613 aa  58.5  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 704 aa  58.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  31.33 
 
 		 628 aa  58.2  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.34 
 
 		 616 aa  57.8  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  24.29 
 
 		 671 aa  57.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.92 
 
 		 656 aa  57.8  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 597 aa  57  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  29.51 
 
 		 617 aa  57  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 686 aa  57.4  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  28.06 
 
 		 680 aa  57.4  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 644 aa  57.4  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  30.43 
 
 		 623 aa  57  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  31.74 
 
 		 647 aa  57.4  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 618 aa  57.4  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  30.94 
 
 		 641 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 635 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 710 aa  56.6  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 657 aa  56.2  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 613 aa  56.2  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>