More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1253 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1253  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 
702 aa  1444    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.98016  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0993  TonB-dependent receptor  35.23 
 
 
735 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0663099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  23.93 
 
 
593 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 
678 aa  100  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  22.19 
 
 
646 aa  99.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  22.13 
 
 
634 aa  95.5  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 
642 aa  93.2  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 
686 aa  92.8  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 
806 aa  89.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  29.73 
 
 
713 aa  87.8  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 
634 aa  85.9  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.12 
 
 
656 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  28.97 
 
 
653 aa  82.4  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 
740 aa  81.6  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  22.32 
 
 
706 aa  81.3  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4390  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 
704 aa  79  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.06 
 
 
688 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 
704 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 
649 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.99 
 
 
615 aa  77.8  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 
688 aa  77.8  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 
726 aa  77.8  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 
699 aa  77.8  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2389  TonB-dependent receptor plug  24.16 
 
 
615 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000607441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  30.77 
 
 
614 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.74 
 
 
615 aa  77.4  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.77 
 
 
614 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 
618 aa  77.4  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.77 
 
 
614 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.77 
 
 
614 aa  77.4  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 
698 aa  77.4  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.22 
 
 
614 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  34.32 
 
 
709 aa  77  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.42 
 
 
631 aa  77  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.24 
 
 
614 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 
651 aa  76.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.24 
 
 
614 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 
736 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.24 
 
 
614 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.24 
 
 
614 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.24 
 
 
614 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  22.06 
 
 
650 aa  75.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 
615 aa  75.5  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  28.81 
 
 
659 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 
648 aa  75.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 
742 aa  75.5  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  27.31 
 
 
618 aa  75.1  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.22 
 
 
614 aa  74.7  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1830  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 
616 aa  74.3  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821839 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  28.51 
 
 
653 aa  74.3  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  31.87 
 
 
623 aa  74.3  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 
665 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  30.29 
 
 
668 aa  73.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  22.09 
 
 
701 aa  73.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.6 
 
 
630 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  22.93 
 
 
652 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.6 
 
 
630 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 
657 aa  73.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 
698 aa  72.4  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2900  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 
609 aa  72  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  27.35 
 
 
653 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  31.05 
 
 
639 aa  71.6  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  30.23 
 
 
613 aa  72  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  31.71 
 
 
929 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 
634 aa  71.2  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 
890 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 
890 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 
743 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  32.02 
 
 
651 aa  70.5  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 
637 aa  70.1  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 
653 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  29.95 
 
 
640 aa  70.5  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 
653 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  21.99 
 
 
763 aa  70.1  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  35.33 
 
 
593 aa  70.1  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 
715 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 
775 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  28.14 
 
 
618 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 
619 aa  69.7  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  28.79 
 
 
680 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 
653 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 
890 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.22 
 
 
623 aa  69.3  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  21.01 
 
 
724 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 
710 aa  68.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
652 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 
652 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  28.43 
 
 
678 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  31.93 
 
 
650 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  26.72 
 
 
693 aa  68.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 
891 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  30 
 
 
614 aa  68.6  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  31.93 
 
 
650 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1001  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 
628 aa  68.6  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.11298  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 
647 aa  68.6  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 
621 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  31.93 
 
 
650 aa  68.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05128  hypothetical protein  32.18 
 
 
458 aa  68.2  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  31.93 
 
 
650 aa  68.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  31.93 
 
 
650 aa  68.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>