More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08506 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  46.11 
 
 		 798 aa  687    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  44.65 
 
 		 807 aa  687    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  47.36 
 
 		 813 aa  746    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  100 
 
 		 846 aa  1702    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 		 821 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6744  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 731 aa  361  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 739 aa  361  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 736 aa  355  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  22.75 
 
 		 687 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  23.24 
 
 		 696 aa  117  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 		 675 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  24.77 
 
 		 688 aa  110  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  23.92 
 
 		 704 aa  106  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  22.84 
 
 		 777 aa  102  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  22.65 
 
 		 703 aa  99.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 782 aa  98.2  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  23.01 
 
 		 717 aa  97.8  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  21.98 
 
 		 774 aa  97.4  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  22.9 
 
 		 774 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  21.84 
 
 		 782 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.43 
 
 		 705 aa  95.5  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  22.21 
 
 		 731 aa  95.9  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  21.84 
 
 		 782 aa  94.7  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  22.4 
 
 		 708 aa  94  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  22.9 
 
 		 711 aa  92  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  22.47 
 
 		 710 aa  91.7  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  22.28 
 
 		 721 aa  90.9  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  22.4 
 
 		 721 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  21.64 
 
 		 700 aa  88.2  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  21.22 
 
 		 693 aa  87.4  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  23.46 
 
 		 731 aa  87  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  22.22 
 
 		 774 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  22.22 
 
 		 774 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  22.66 
 
 		 784 aa  83.2  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  22.13 
 
 		 774 aa  82.8  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  22.08 
 
 		 774 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  22.08 
 
 		 774 aa  81.6  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  21.51 
 
 		 712 aa  80.9  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  22.56 
 
 		 807 aa  80.9  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  22.17 
 
 		 690 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  21.63 
 
 		 809 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  21.48 
 
 		 809 aa  78.2  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 753 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 709 aa  75.5  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  21.41 
 
 		 809 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 769 aa  75.1  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 710 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  19.81 
 
 		 812 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  35.53 
 
 		 518 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  20.9 
 
 		 809 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  21.48 
 
 		 795 aa  71.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  22.47 
 
 		 723 aa  70.5  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 621 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  21.48 
 
 		 809 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  21.57 
 
 		 784 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  21.63 
 
 		 784 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  21.63 
 
 		 713 aa  65.1  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  21.1 
 
 		 720 aa  65.1  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 		 814 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0833  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 411 aa  64.3  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0977  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 411 aa  64.3  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  29.63 
 
 		 659 aa  63.9  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  24.48 
 
 		 691 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 652 aa  61.6  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  24.75 
 
 		 760 aa  61.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 734 aa  60.8  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  21.19 
 
 		 715 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  23.24 
 
 		 808 aa  60.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 653 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  24.66 
 
 		 782 aa  60.1  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  23.39 
 
 		 742 aa  59.3  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 793 aa  58.9  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  21.68 
 
 		 701 aa  58.9  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  29.17 
 
 		 653 aa  58.9  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  21.99 
 
 		 794 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 791 aa  58.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  21.89 
 
 		 711 aa  58.5  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  29.09 
 
 		 653 aa  58.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 653 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  22.08 
 
 		 860 aa  58.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 726 aa  58.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  28.48 
 
 		 653 aa  57.8  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  23.36 
 
 		 824 aa  57.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  23.17 
 
 		 742 aa  57.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  24.58 
 
 		 652 aa  57.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 710 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 653 aa  57.4  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  22.94 
 
 		 738 aa  57.4  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  25.24 
 
 		 626 aa  57.4  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 665 aa  57  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  23.36 
 
 		 788 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  21.91 
 
 		 749 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.53 
 
 		 711 aa  57  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 848 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 653 aa  57  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1830  TonB-dependent receptor plug  27.72 
 
 		 616 aa  57  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 720 aa  56.6  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 738 aa  55.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 738 aa  55.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 681 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>