163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0379 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0379  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 888 aa  1780    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0418446  normal  0.660962 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2575  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 897 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.118608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0313  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 897 aa  450  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2438  TonB-dependent receptor  33.84 
 
 		 892 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615124  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3993  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 897 aa  340  5.9999999999999996e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.494791  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03436  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 856 aa  305  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3580  TonB-dependent receptor, plug  30.24 
 
 		 894 aa  297  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0553281  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0637  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 916 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0978738  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1056  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 888 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0268559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1988  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1003 aa  263  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485528  normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1493  outer membrane protein  26.35 
 
 		 929 aa  238  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.684854  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 924 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 957 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 1090 aa  207  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 957 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 933 aa  195  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 931 aa  181  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 920 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 1051 aa  159  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  22.63 
 
 		 922 aa  150  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 927 aa  139  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 917 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 		 962 aa  118  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3857  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 1077 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  22.66 
 
 		 919 aa  95.5  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 941 aa  92.8  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 917 aa  92  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 944 aa  92  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 942 aa  91.7  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 943 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 901 aa  79.3  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 932 aa  77.8  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 842 aa  75.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  34.59 
 
 		 853 aa  75.9  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 836 aa  74.3  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  31.76 
 
 		 838 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  26.74 
 
 		 972 aa  72.8  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 936 aa  68.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 991 aa  68.6  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 945 aa  67.4  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 946 aa  65.9  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 935 aa  65.1  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 915 aa  63.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 880 aa  63.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 972 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 961 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 938 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 859 aa  62.4  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 885 aa  62  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03327  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 862 aa  60.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2652  3-dehydroquinate synthase  29.57 
 
 		 1210 aa  59.7  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000360118  normal  0.0199769 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 881 aa  58.5  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  31.03 
 
 		 919 aa  57.4  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01644  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 875 aa  56.6  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 922 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 894 aa  57  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 962 aa  57  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 746 aa  56.2  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1279  rhodanese-like protein  28.49 
 
 		 990 aa  55.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000246729  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 1001 aa  55.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 908 aa  55.1  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 914 aa  55.1  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 888 aa  55.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1313  TonB-dependent receptor, plug  28.57 
 
 		 978 aa  55.1  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120074  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 927 aa  54.7  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.14 
 
 		 992 aa  54.7  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4375  TonB-dependent receptor plug  23.62 
 
 		 998 aa  54.7  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000110993  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 943 aa  53.9  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03790  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 982 aa  53.5  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 998 aa  54.3  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 918 aa  53.9  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3650  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 1012 aa  53.9  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000400327  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 958 aa  53.9  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04688  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 918 aa  53.9  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03792  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 982 aa  53.5  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  27.32 
 
 		 986 aa  53.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 958 aa  53.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2610  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 990 aa  53.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1938  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 971 aa  53.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886775  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01579  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 889 aa  53.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.419044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1401  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 878 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1437  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 878 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0321  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 934 aa  53.5  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0815676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2944  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 878 aa  52.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02733  TonB-dependent outer membrane receptor  28.91 
 
 		 897 aa  52.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02805  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 984 aa  52  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 948 aa  52  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1410  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 878 aa  51.6  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  25.79 
 
 		 968 aa  51.2  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 901 aa  51.6  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 875 aa  51.2  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2407  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 984 aa  51.6  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000117567  normal  0.325532 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2708  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 882 aa  51.2  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0443118  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 936 aa  51.2  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2694  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 945 aa  51.2  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00189695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 1006 aa  51.2  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1966  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 1240 aa  50.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00321927  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 936 aa  50.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 900 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 938 aa  50.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>