30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26650 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26650  hypothetical protein  100 
 
 		 845 aa  1615    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.822995  normal  0.342993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1023  hypothetical protein  48.82 
 
 		 980 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26660  hypothetical protein  32.55 
 
 		 738 aa  263  8.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.794226  normal  0.474919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1022  hypothetical protein  30.02 
 
 		 804 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1024  Cna B domain protein  31.82 
 
 		 2332 aa  97.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5377  hypothetical protein  32.98 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.300585  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  28.26 
 
 		 1057 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26640  putative collagen-binding protein  31.48 
 
 		 2148 aa  63.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1895  hypothetical protein  31.91 
 
 		 928 aa  62  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.123518  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  29.07 
 
 		 1053 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3801  fibronectin type III domain-containing protein  26.56 
 
 		 484 aa  60.1  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00993794  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4381  Ricin B lectin  24.89 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  31.69 
 
 		 617 aa  58.9  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3169  S-layer domain-containing protein  32.89 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  24.48 
 
 		 1157 aa  57.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4382  Ricin B lectin  24.89 
 
 		 490 aa  56.2  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.488443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  23.96 
 
 		 1167 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3178  S-layer domain-containing protein  29.53 
 
 		 1518 aa  54.7  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  unclonable  0.0033347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2929  hypothetical protein  27.54 
 
 		 447 aa  53.5  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  25.33 
 
 		 894 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 828 aa  49.7  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  39.07 
 
 		 727 aa  49.7  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0935  hypothetical protein  25.99 
 
 		 614 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.410995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 852 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  27.89 
 
 		 1578 aa  48.1  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2254  hypothetical protein  27.18 
 
 		 443 aa  47  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136366  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  24.59 
 
 		 618 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  26.92 
 
 		 3373 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  30.25 
 
 		 1202 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.81 
 
 		 1710 aa  44.3  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>