21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2929 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2929  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  883    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2254  hypothetical protein  32.89 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136366  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5377  hypothetical protein  30.22 
 
 		 446 aa  153  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.300585  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4381  Ricin B lectin  32.16 
 
 		 476 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4382  Ricin B lectin  32.14 
 
 		 490 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.488443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3801  fibronectin type III domain-containing protein  32.92 
 
 		 484 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00993794  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  30.51 
 
 		 1167 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  28.17 
 
 		 1057 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  28.76 
 
 		 1053 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  28.98 
 
 		 1157 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1023  hypothetical protein  26.47 
 
 		 980 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  26.59 
 
 		 894 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26650  hypothetical protein  25.91 
 
 		 845 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.822995  normal  0.342993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  24.14 
 
 		 894 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  24.02 
 
 		 618 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1022  hypothetical protein  27.23 
 
 		 804 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26660  hypothetical protein  29.27 
 
 		 738 aa  53.9  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.794226  normal  0.474919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1670  protein kinase  29.79 
 
 		 1073 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1954  hypothetical protein  22.81 
 
 		 745 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.539485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  26.95 
 
 		 1034 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  26.23 
 
 		 617 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>