18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4381 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4381  Ricin B lectin  100 
 
 
476 aa  961    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4382  Ricin B lectin  94.01 
 
 
490 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.488443 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2254  hypothetical protein  36.8 
 
 
443 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136366  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5377  hypothetical protein  32.49 
 
 
446 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.300585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2929  hypothetical protein  34.03 
 
 
447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  26.79 
 
 
1157 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  27.05 
 
 
1034 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3801  fibronectin type III domain-containing protein  25.41 
 
 
484 aa  73.2  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00993794  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  24.89 
 
 
1167 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1670  protein kinase  25.62 
 
 
1073 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.375386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  28.3 
 
 
894 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  25 
 
 
1053 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26650  hypothetical protein  25.19 
 
 
845 aa  57  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.822995  normal  0.342993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  20.83 
 
 
1057 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1022  hypothetical protein  24.74 
 
 
804 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  23.96 
 
 
894 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  20.87 
 
 
618 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1023  hypothetical protein  27.42 
 
 
980 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>