21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2254 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2254  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  868    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136366  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5377  hypothetical protein  34.63 
 
 
446 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.300585  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4382  Ricin B lectin  37.6 
 
 
490 aa  156  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.488443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4381  Ricin B lectin  37.39 
 
 
476 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3801  fibronectin type III domain-containing protein  34.1 
 
 
484 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00993794  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  32.1 
 
 
1057 aa  94  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  33.8 
 
 
1053 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  29.2 
 
 
1157 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  30.29 
 
 
1167 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  28.96 
 
 
894 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2929  hypothetical protein  37.62 
 
 
447 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  27.1 
 
 
618 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  27.31 
 
 
894 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1023  hypothetical protein  29.61 
 
 
980 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  24.37 
 
 
1034 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1895  hypothetical protein  32.04 
 
 
928 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.123518  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26650  hypothetical protein  26.67 
 
 
845 aa  51.6  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.822995  normal  0.342993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  28.93 
 
 
1428 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26660  hypothetical protein  30.25 
 
 
738 aa  47  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.794226  normal  0.474919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1670  protein kinase  25.73 
 
 
1073 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.375386 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1022  hypothetical protein  25.65 
 
 
804 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>