More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1670 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  84.42 
 
 
1034 aa  1295    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1670  protein kinase  100 
 
 
1073 aa  2120    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.375386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  48.78 
 
 
1057 aa  607  9.999999999999999e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  49.03 
 
 
1053 aa  604  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  42.35 
 
 
618 aa  464  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  42.23 
 
 
617 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.8 
 
 
650 aa  224  6e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.2 
 
 
667 aa  218  5.9999999999999996e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  43.79 
 
 
863 aa  217  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.55 
 
 
645 aa  217  9.999999999999999e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  37.07 
 
 
599 aa  216  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  33.79 
 
 
1157 aa  214  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  45.07 
 
 
880 aa  213  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  42.03 
 
 
571 aa  213  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  43.77 
 
 
651 aa  212  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.36 
 
 
520 aa  212  3e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  40.38 
 
 
618 aa  212  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  41.55 
 
 
528 aa  211  7e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.85 
 
 
668 aa  210  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  40.28 
 
 
641 aa  210  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3400  Serine/threonine protein kinase-related protein  41.52 
 
 
1373 aa  208  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.71 
 
 
653 aa  208  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  41.34 
 
 
615 aa  208  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.73 
 
 
647 aa  207  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  39.44 
 
 
561 aa  207  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  37.07 
 
 
634 aa  207  8e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.24 
 
 
676 aa  207  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  41.7 
 
 
593 aa  205  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.45 
 
 
584 aa  205  5e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.5 
 
 
681 aa  204  6e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.89 
 
 
627 aa  204  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  44.29 
 
 
520 aa  204  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  37.88 
 
 
565 aa  204  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  41.34 
 
 
672 aa  204  9e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.82 
 
 
598 aa  203  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3396  serine/threonine protein kinase  41.43 
 
 
604 aa  203  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0692149  normal  0.384469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  42.2 
 
 
661 aa  203  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.11 
 
 
641 aa  202  1.9999999999999998e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  41.72 
 
 
666 aa  202  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  38.38 
 
 
574 aa  202  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.87 
 
 
613 aa  202  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0201  serine/threonine protein kinase  41 
 
 
729 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
671 aa  202  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.83 
 
 
635 aa  201  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  43.32 
 
 
598 aa  201  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  38.04 
 
 
626 aa  201  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2094  protein kinase  37.4 
 
 
654 aa  201  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.285839  normal  0.150566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3789  serine/threonine protein kinase  42.8 
 
 
563 aa  201  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6755  serine/threonine protein kinase  40.21 
 
 
597 aa  201  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  41.37 
 
 
569 aa  200  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  39.35 
 
 
625 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  38.65 
 
 
638 aa  200  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.24 
 
 
579 aa  199  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4569  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  41 
 
 
655 aa  199  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.967984  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  38.99 
 
 
700 aa  199  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  39.08 
 
 
618 aa  199  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0112  protein kinase  46 
 
 
469 aa  198  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351579  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1881  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  42.44 
 
 
553 aa  198  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211563  normal  0.848912 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  36.76 
 
 
776 aa  198  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  41.07 
 
 
585 aa  197  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1582  Serine/threonine protein kinase-related protein  40.38 
 
 
527 aa  197  8.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.278866  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  40.37 
 
 
624 aa  197  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  40.37 
 
 
624 aa  197  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  38.41 
 
 
614 aa  197  9e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  40.37 
 
 
624 aa  197  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  39.05 
 
 
583 aa  197  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  40.21 
 
 
1044 aa  197  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0074  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  38.93 
 
 
967 aa  196  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  41.85 
 
 
628 aa  197  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  41.61 
 
 
614 aa  197  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.96 
 
 
591 aa  197  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.72 
 
 
668 aa  197  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  41.18 
 
 
626 aa  197  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1234  serine/threonine protein kinase  40.07 
 
 
539 aa  197  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  41.92 
 
 
623 aa  196  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  40.93 
 
 
468 aa  196  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.36 
 
 
700 aa  196  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  33.99 
 
 
673 aa  196  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.62 
 
 
601 aa  196  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  39.58 
 
 
502 aa  195  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.64 
 
 
603 aa  195  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  40.57 
 
 
692 aa  195  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  39.27 
 
 
604 aa  195  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  41.18 
 
 
625 aa  194  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  38.69 
 
 
586 aa  195  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.52 
 
 
652 aa  194  6e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.59 
 
 
681 aa  194  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.99 
 
 
681 aa  194  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  38.81 
 
 
636 aa  194  8e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  41.46 
 
 
586 aa  194  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  41.79 
 
 
723 aa  194  9e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0497  serine/threonine protein kinase  41.26 
 
 
531 aa  194  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  40.67 
 
 
758 aa  194  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.89 
 
 
916 aa  194  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.48 
 
 
607 aa  193  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  42.7 
 
 
889 aa  194  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.85 
 
 
594 aa  193  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4975  serine/threonine protein kinase  38.87 
 
 
580 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  42.24 
 
 
646 aa  192  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  42.55 
 
 
582 aa  193  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>