19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3801 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3801  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 484 aa  962    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00993794  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2254  hypothetical protein  32.81 
 
 		 443 aa  99.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136366  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5377  hypothetical protein  32.07 
 
 		 446 aa  97.8  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.300585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2929  hypothetical protein  36 
 
 		 447 aa  96.7  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4382  Ricin B lectin  26.49 
 
 		 490 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.488443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4381  Ricin B lectin  25.41 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  30.49 
 
 		 1053 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  30.77 
 
 		 1034 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  27.78 
 
 		 618 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  28.66 
 
 		 1057 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1670  protein kinase  31.25 
 
 		 1073 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  27.49 
 
 		 894 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26650  hypothetical protein  26.58 
 
 		 845 aa  53.9  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.822995  normal  0.342993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  24.42 
 
 		 1167 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  24.42 
 
 		 1157 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1022  hypothetical protein  22.67 
 
 		 804 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  24.84 
 
 		 894 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1023  hypothetical protein  24.18 
 
 		 980 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  25.27 
 
 		 617 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>