More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0234 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3806  peptidase S41  88.21 
 
 		 509 aa  766    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0686  peptidase S41  98.72 
 
 		 539 aa  929    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0234  peptidase S41  100 
 
 		 469 aa  938    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0718  peptidase S41  99.79 
 
 		 564 aa  940    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  32.58 
 
 		 524 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  32.58 
 
 		 524 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  32.58 
 
 		 530 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  32.58 
 
 		 524 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  32.58 
 
 		 524 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  32.58 
 
 		 524 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  32.58 
 
 		 530 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  32.81 
 
 		 515 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  32.43 
 
 		 521 aa  195  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  33.26 
 
 		 515 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  33.26 
 
 		 515 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  33.26 
 
 		 515 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  32.81 
 
 		 515 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  32.58 
 
 		 513 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  32.58 
 
 		 511 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  32.53 
 
 		 530 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  31.46 
 
 		 526 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  30.93 
 
 		 538 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  32.29 
 
 		 522 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  28.92 
 
 		 477 aa  177  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  29.86 
 
 		 532 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  30.47 
 
 		 550 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  29.86 
 
 		 535 aa  176  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  32.82 
 
 		 478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  32 
 
 		 478 aa  172  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  32.35 
 
 		 479 aa  172  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  30.96 
 
 		 478 aa  171  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  30.96 
 
 		 478 aa  170  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  32.44 
 
 		 481 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  30.56 
 
 		 549 aa  170  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  30.41 
 
 		 479 aa  170  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  30.09 
 
 		 479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  28.7 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  30.85 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  30.29 
 
 		 482 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  29.45 
 
 		 490 aa  152  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  31.68 
 
 		 468 aa  150  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  32.31 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  27.69 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  32 
 
 		 476 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  31.37 
 
 		 439 aa  144  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  31.17 
 
 		 444 aa  144  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  28.09 
 
 		 481 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  27.17 
 
 		 443 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  26.09 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  28.77 
 
 		 445 aa  136  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  28.77 
 
 		 445 aa  136  9e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  28.32 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  29.17 
 
 		 418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  28.08 
 
 		 494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  28.64 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  29.08 
 
 		 484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  29.15 
 
 		 401 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  26.3 
 
 		 444 aa  134  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  29.15 
 
 		 401 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  29.7 
 
 		 444 aa  134  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  29.94 
 
 		 424 aa  133  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  26.07 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  30.09 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  27.46 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  25 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  26.3 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  29.81 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  29.66 
 
 		 482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  29.66 
 
 		 482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  28.82 
 
 		 450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  28.06 
 
 		 461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  26.74 
 
 		 437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  31.82 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  29.66 
 
 		 424 aa  131  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  29.12 
 
 		 429 aa  131  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  29.28 
 
 		 401 aa  130  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  29.08 
 
 		 554 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  30.2 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  30.09 
 
 		 434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 		 401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  26.89 
 
 		 439 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  31.34 
 
 		 427 aa  129  8.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 		 401 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  27.3 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  31.42 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  26.35 
 
 		 567 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  31.49 
 
 		 444 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  30.94 
 
 		 429 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  27.61 
 
 		 428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  29.49 
 
 		 440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  27.82 
 
 		 432 aa  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  26.15 
 
 		 439 aa  127  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  28.7 
 
 		 401 aa  127  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  29.74 
 
 		 560 aa  127  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  31.23 
 
 		 428 aa  126  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  31.49 
 
 		 444 aa  127  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  28.69 
 
 		 457 aa  126  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  27.19 
 
 		 439 aa  126  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  31.93 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  27.23 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>