More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0718 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3806  peptidase S41  83.27 
 
 
509 aa  778    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0686  peptidase S41  95.73 
 
 
539 aa  932    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407654  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0234  peptidase S41  99.79 
 
 
469 aa  940    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0718  peptidase S41  100 
 
 
564 aa  1120    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  32.58 
 
 
530 aa  197  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  32.58 
 
 
530 aa  197  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  32.58 
 
 
524 aa  197  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  32.58 
 
 
524 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  32.58 
 
 
524 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  32.58 
 
 
524 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  32.58 
 
 
524 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  32.81 
 
 
515 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  32.43 
 
 
521 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  33.26 
 
 
515 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  33.26 
 
 
515 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  33.26 
 
 
515 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  32.81 
 
 
515 aa  190  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  32.54 
 
 
530 aa  189  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  32.58 
 
 
513 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  32.58 
 
 
511 aa  187  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  31.11 
 
 
538 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  31.46 
 
 
526 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  32.29 
 
 
522 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  29.57 
 
 
532 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  30.65 
 
 
550 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  29.4 
 
 
535 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  28.92 
 
 
477 aa  176  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  33.03 
 
 
478 aa  173  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  32.2 
 
 
478 aa  172  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  32.35 
 
 
479 aa  171  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  30.73 
 
 
549 aa  171  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  30.96 
 
 
478 aa  170  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  32.44 
 
 
481 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  30.96 
 
 
478 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  30.41 
 
 
479 aa  169  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  30.09 
 
 
479 aa  166  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  28.7 
 
 
477 aa  163  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  30.85 
 
 
480 aa  157  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  30.29 
 
 
482 aa  154  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  29.45 
 
 
490 aa  151  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  31.68 
 
 
468 aa  148  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  32.31 
 
 
426 aa  147  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  27.69 
 
 
480 aa  146  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  32 
 
 
476 aa  146  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  31.37 
 
 
439 aa  143  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  31.17 
 
 
444 aa  143  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  27.47 
 
 
443 aa  141  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  28.09 
 
 
481 aa  139  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  29.22 
 
 
463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  28.08 
 
 
494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  26.09 
 
 
435 aa  134  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  28.57 
 
 
445 aa  134  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  28.57 
 
 
445 aa  134  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  29.08 
 
 
484 aa  134  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  29.17 
 
 
418 aa  133  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  28.64 
 
 
455 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  28.71 
 
 
482 aa  133  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  28.71 
 
 
482 aa  133  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  29.15 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  30.03 
 
 
424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  29.15 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  29.7 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  24.84 
 
 
444 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  29.81 
 
 
400 aa  131  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  30.09 
 
 
418 aa  131  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  25.35 
 
 
434 aa  131  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  27.06 
 
 
428 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  26.07 
 
 
444 aa  131  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  29.76 
 
 
424 aa  131  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  26.3 
 
 
444 aa  131  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  26.67 
 
 
446 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  29.38 
 
 
554 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  29.12 
 
 
429 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  28.06 
 
 
461 aa  130  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  29.86 
 
 
401 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  28.82 
 
 
450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  29.27 
 
 
434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  30.2 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  31.82 
 
 
444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  31.34 
 
 
427 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  26.89 
 
 
439 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  28.06 
 
 
437 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 
401 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  26.35 
 
 
567 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 
401 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  29.46 
 
 
442 aa  128  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  31.42 
 
 
430 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  31.23 
 
 
428 aa  126  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  26.16 
 
 
439 aa  127  8.000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  27.08 
 
 
496 aa  126  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  27.08 
 
 
496 aa  126  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  29.49 
 
 
440 aa  126  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  27.88 
 
 
428 aa  126  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  30.94 
 
 
429 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  29.28 
 
 
401 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  31.49 
 
 
444 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  31.49 
 
 
444 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  29.74 
 
 
560 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  25.75 
 
 
491 aa  125  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  26.54 
 
 
428 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>