104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03863 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03863  glycosyl hydrolase family 10  100 
 
 
271 aa  564  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3590  glycoside hydrolase family protein  60.78 
 
 
325 aa  333  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.013688  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03861  glycosyl hydrolase family 10  56.42 
 
 
325 aa  301  7.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260596  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  49.26 
 
 
721 aa  272  5.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  45.56 
 
 
997 aa  250  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  36.13 
 
 
541 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  38.74 
 
 
1186 aa  181  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  36.7 
 
 
574 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  30.58 
 
 
1247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  28.28 
 
 
1414 aa  123  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  29.32 
 
 
820 aa  91.3  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  27.68 
 
 
488 aa  89.7  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  27.65 
 
 
815 aa  89  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  27.23 
 
 
639 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  29.63 
 
 
497 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  27.5 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  27.41 
 
 
477 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  27.34 
 
 
674 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  29.15 
 
 
756 aa  73.2  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  29.6 
 
 
474 aa  72.8  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  29.2 
 
 
454 aa  72.4  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  26.72 
 
 
457 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  26.07 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  23.81 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  31.11 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  26.46 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  27.02 
 
 
495 aa  69.7  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  27.83 
 
 
491 aa  69.3  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  27.24 
 
 
628 aa  68.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  31.01 
 
 
498 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  27.31 
 
 
1001 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  27.76 
 
 
472 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  28.87 
 
 
829 aa  66.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  28.03 
 
 
373 aa  65.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  24.14 
 
 
760 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  25 
 
 
337 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  28.27 
 
 
457 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  26.12 
 
 
543 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  28.12 
 
 
333 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  26.91 
 
 
357 aa  63.2  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  28.39 
 
 
451 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  26.57 
 
 
383 aa  63.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  23.73 
 
 
323 aa  62.4  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  24 
 
 
364 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  24.16 
 
 
371 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  24.52 
 
 
619 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  26.34 
 
 
503 aa  60.1  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  26.01 
 
 
417 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  25.61 
 
 
366 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  23.63 
 
 
837 aa  59.3  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  25.18 
 
 
1050 aa  59.3  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  27.69 
 
 
370 aa  59.3  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  27.78 
 
 
398 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  25.1 
 
 
487 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3209  glycoside hydrolase family protein  28.74 
 
 
606 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.818517  normal  0.245162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  26.15 
 
 
474 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  22.53 
 
 
463 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  24.8 
 
 
756 aa  56.6  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  27.42 
 
 
328 aa  56.2  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  23.14 
 
 
678 aa  56.2  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  26.39 
 
 
392 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  26.11 
 
 
770 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  25.7 
 
 
778 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  22.87 
 
 
370 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  23.48 
 
 
373 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  23.6 
 
 
376 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  25.49 
 
 
381 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  32.57 
 
 
912 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  25.1 
 
 
1018 aa  53.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  26.72 
 
 
338 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  23.55 
 
 
407 aa  52.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  25.91 
 
 
388 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  25.38 
 
 
359 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  24.81 
 
 
490 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  22.95 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  27.73 
 
 
423 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0323  TonB-like  32.47 
 
 
670 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000416946  normal  0.597274 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.97 
 
 
697 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2106  glycoside hydrolase family 10  29.73 
 
 
558 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.390174  normal  0.187838 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  23.53 
 
 
399 aa  49.7  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  24.23 
 
 
389 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  25.79 
 
 
1077 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  24.62 
 
 
1059 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  24.62 
 
 
1059 aa  48.5  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  26.18 
 
 
401 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  25.45 
 
 
465 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  26.25 
 
 
1020 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  23.08 
 
 
1037 aa  47.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  25.1 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  24.26 
 
 
368 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  21.91 
 
 
689 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  23.29 
 
 
324 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  21.69 
 
 
369 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  24.43 
 
 
394 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  25.76 
 
 
374 aa  45.8  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2724  glycoside hydrolase family 10  20.21 
 
 
408 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.85294  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  23.97 
 
 
1146 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  23.86 
 
 
1780 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  21.96 
 
 
520 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0896  glycoside hydrolase family 10  30.5 
 
 
434 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>