63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1273 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1273  alpha-L-arabinofuranosidase B  100 
 
 		 481 aa  972    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  44.69 
 
 		 982 aa  141  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  52.31 
 
 		 707 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  27.55 
 
 		 760 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  47.59 
 
 		 580 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  28.4 
 
 		 644 aa  123  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1971  alpha-L-arabinofuranosidase B  42.75 
 
 		 478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000055654  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  26.45 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  29.49 
 
 		 671 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1740  hypothetical protein  30.89 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  27.2 
 
 		 522 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2974  hypothetical protein  29.43 
 
 		 403 aa  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0062  alpha-L-arabinofuranosidase B  33.33 
 
 		 854 aa  85.1  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.649597  normal  0.531326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3360  hypothetical protein  27.31 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2037  hypothetical protein  25.85 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  39.53 
 
 		 980 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0260  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30 
 
 		 707 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.500481  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01571  Alpha-L-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74288]  38.89 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.611829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5160  Xylan 1,4-beta-xylosidase  38.82 
 
 		 519 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0027116 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2308  hypothetical protein  25.5 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3203  membrane associated protein  28.07 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220065  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2522  membrane associated protein  23.41 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0879988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3136  membrane associated protein  28.51 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3230  hypothetical protein  34.38 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3444  hypothetical protein  27.88 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4760  hypothetical protein  24.89 
 
 		 450 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00173239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3482  hypothetical protein  34.13 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.381861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0073  hypothetical protein  27.19 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3432  hypothetical protein  26.99 
 
 		 444 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3121  hypothetical protein  25.55 
 
 		 457 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0295714  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7065  alpha-L-arabinofuranosidase B  35.63 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0253597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.57 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0662  hypothetical protein  24.03 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00226884  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3440  hypothetical protein  29.19 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.177928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  40.43 
 
 		 830 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1814  hypothetical protein  26.99 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0833  conserved hypothetical membrane associated protein  30 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7019  alpha-L-arabinofuranosidase B  34.48 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  28.57 
 
 		 1567 aa  53.9  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  38.37 
 
 		 555 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.7 
 
 		 261 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  48.53 
 
 		 433 aa  50.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0591  hypothetical protein  22.73 
 
 		 271 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000298116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  47.95 
 
 		 1281 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  34.59 
 
 		 551 aa  47.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  34 
 
 		 489 aa  47.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1435  hypothetical protein  35.38 
 
 		 3437 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0503508 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  43.48 
 
 		 846 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2289  peptidase M23B  36.49 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000911471  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  35.63 
 
 		 484 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1002  hypothetical protein  40.85 
 
 		 718 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  46.77 
 
 		 1096 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0234  hypothetical protein  42.22 
 
 		 128 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000287276  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2790  RNA pseudouridine synthase  32.81 
 
 		 322 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39253  predicted protein  35.35 
 
 		 1538 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  37.86 
 
 		 521 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  30.95 
 
 		 582 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  38.67 
 
 		 840 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  31.75 
 
 		 356 aa  43.9  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  36.11 
 
 		 521 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  34.07 
 
 		 489 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.42 
 
 		 257 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1697  hypothetical protein  22.46 
 
 		 411 aa  43.1  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.600188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>