28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0833 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0833  conserved hypothetical membrane associated protein  100 
 
 
349 aa  706    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1814  hypothetical protein  32.48 
 
 
428 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3432  hypothetical protein  36.28 
 
 
444 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3230  hypothetical protein  35.62 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3482  hypothetical protein  35.62 
 
 
440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.381861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3444  hypothetical protein  32.05 
 
 
438 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3203  membrane associated protein  35.62 
 
 
426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3136  membrane associated protein  35.62 
 
 
456 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3121  hypothetical protein  32.46 
 
 
457 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0295714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3440  hypothetical protein  35.96 
 
 
503 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.177928  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0073  hypothetical protein  31.89 
 
 
330 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4760  hypothetical protein  30.8 
 
 
450 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00173239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3360  hypothetical protein  27.42 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651138  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2522  membrane associated protein  24.05 
 
 
540 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0879988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2308  hypothetical protein  28.3 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1697  hypothetical protein  30.88 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  27.73 
 
 
486 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 
760 aa  63.5  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1273  alpha-L-arabinofuranosidase B  30 
 
 
481 aa  57.4  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1740  hypothetical protein  22.48 
 
 
413 aa  56.6  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0260  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  22.4 
 
 
707 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.500481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  24.47 
 
 
522 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0662  hypothetical protein  25 
 
 
444 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00226884  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  25.64 
 
 
671 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  24.58 
 
 
644 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1585  hypothetical protein  26.56 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2974  hypothetical protein  27.27 
 
 
403 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0945  hypothetical protein  27.5 
 
 
377 aa  43.1  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000150754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>