52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3440 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3440  hypothetical protein  100 
 
 
503 aa  987    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.177928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3230  hypothetical protein  72.28 
 
 
441 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3482  hypothetical protein  72.28 
 
 
440 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.381861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3136  membrane associated protein  73.82 
 
 
456 aa  560  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3444  hypothetical protein  69.98 
 
 
438 aa  548  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3203  membrane associated protein  74.31 
 
 
426 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1814  hypothetical protein  68.42 
 
 
428 aa  513  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3121  hypothetical protein  54.26 
 
 
457 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0295714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0833  conserved hypothetical membrane associated protein  35.96 
 
 
349 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1740  hypothetical protein  29.3 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0073  hypothetical protein  30.09 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2522  membrane associated protein  27.48 
 
 
540 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0879988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  30.14 
 
 
813 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  33.18 
 
 
748 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3360  hypothetical protein  27.03 
 
 
363 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651138  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0662  hypothetical protein  24.28 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00226884  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  29.41 
 
 
706 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4760  hypothetical protein  22.78 
 
 
450 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00173239  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  24.4 
 
 
760 aa  63.9  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0328  pseudouridine synthase  27.63 
 
 
567 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106742 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  26.64 
 
 
712 aa  60.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  29.34 
 
 
1147 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  28.51 
 
 
486 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  33.67 
 
 
522 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  33.64 
 
 
1451 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2308  hypothetical protein  25.69 
 
 
387 aa  57.8  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  30.53 
 
 
643 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1273  alpha-L-arabinofuranosidase B  33.61 
 
 
481 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  31.31 
 
 
1168 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  28.95 
 
 
585 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  33.19 
 
 
936 aa  53.5  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0260  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.65 
 
 
707 aa  53.5  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.500481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  26.83 
 
 
512 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  26.97 
 
 
587 aa  50.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  29.94 
 
 
481 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  29.94 
 
 
478 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  34.15 
 
 
644 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1697  hypothetical protein  30.83 
 
 
411 aa  47.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  22.07 
 
 
750 aa  47.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  42.35 
 
 
298 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  26.6 
 
 
2144 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  35.93 
 
 
1029 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  32.63 
 
 
671 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  29.49 
 
 
2914 aa  45.1  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0729  hemolysin-type calcium-binding region  34.65 
 
 
7072 aa  45.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.971517 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  30.73 
 
 
466 aa  44.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1746  PE-PGRS family protein  38.5 
 
 
248 aa  44.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000877581  n/a   
 
 
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  22.22 
 
 
9867 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  25 
 
 
2622 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  32.73 
 
 
468 aa  43.9  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1585  hypothetical protein  25.47 
 
 
332 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  28.71 
 
 
3787 aa  43.5  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>