17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1493 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1493  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 		 633 aa  1223    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5232  hypothetical protein  45.29 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3471  hypothetical protein  28.05 
 
 		 646 aa  75.1  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.245401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8370  putative secreted protein  37.65 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9225  hypothetical protein  28.53 
 
 		 532 aa  73.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5309  putative secreted protein  36.9 
 
 		 190 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0146  surface protein  31.79 
 
 		 266 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5233  putative chaplin  61.9 
 
 		 79 aa  61.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  25 
 
 		 687 aa  50.4  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  40.3 
 
 		 248 aa  50.4  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  31.76 
 
 		 659 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0126  hypothetical protein  28.07 
 
 		 352 aa  48.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0192432 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0056  dehydrogenase subunit  37.14 
 
 		 524 aa  48.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7049  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1020 aa  47.4  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  29.46 
 
 		 2397 aa  47  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0074  hypothetical protein  35.48 
 
 		 358 aa  44.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5349  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.33 
 
 		 348 aa  44.3  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  0.183228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>