189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3042 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3042  PKD  100 
 
 
428 aa  877    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.971034  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  38.18 
 
 
1094 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  38.61 
 
 
1882 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  37.25 
 
 
575 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  37.97 
 
 
547 aa  99.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  36.41 
 
 
2122 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  35.2 
 
 
685 aa  97.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  35.03 
 
 
752 aa  97.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  40.27 
 
 
1862 aa  97.4  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  36.56 
 
 
184 aa  97.1  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  37.74 
 
 
2036 aa  97.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  38.71 
 
 
1682 aa  97.1  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  37.5 
 
 
1842 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  37.25 
 
 
791 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  40 
 
 
1300 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  38.22 
 
 
1667 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  33.89 
 
 
669 aa  94  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  33.33 
 
 
551 aa  93.2  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  36.67 
 
 
644 aa  93.2  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  35.9 
 
 
615 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  37.74 
 
 
1969 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  35.44 
 
 
859 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  33.16 
 
 
679 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  37.5 
 
 
1241 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  32.23 
 
 
838 aa  90.9  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  35.5 
 
 
2272 aa  90.1  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  36.87 
 
 
2176 aa  90.1  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  37.18 
 
 
561 aa  89.7  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  32.22 
 
 
713 aa  89.7  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  36.25 
 
 
735 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  37.09 
 
 
978 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  38.75 
 
 
1361 aa  89  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  34.91 
 
 
1120 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  42.45 
 
 
845 aa  88.6  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  35.53 
 
 
658 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  35.33 
 
 
2000 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  35.81 
 
 
930 aa  87  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  41.73 
 
 
870 aa  87.4  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  39.6 
 
 
816 aa  87  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  35.71 
 
 
941 aa  86.3  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  37.66 
 
 
528 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  36.54 
 
 
560 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  36.77 
 
 
581 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  35.53 
 
 
675 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  33.65 
 
 
963 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  39.46 
 
 
1231 aa  84.7  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  38.36 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  36.48 
 
 
869 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  35.29 
 
 
3295 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  33.33 
 
 
1931 aa  83.2  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  38.41 
 
 
519 aa  83.2  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  36.59 
 
 
1311 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  37.25 
 
 
1282 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  36.47 
 
 
1236 aa  82  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  34.62 
 
 
1528 aa  81.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  40.29 
 
 
719 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  36.13 
 
 
2554 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  34.38 
 
 
1356 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  38.57 
 
 
958 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  32.45 
 
 
861 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  34.62 
 
 
1732 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  39.31 
 
 
840 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  32.94 
 
 
929 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  34.23 
 
 
819 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  36.67 
 
 
500 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  33.72 
 
 
971 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  34.91 
 
 
910 aa  76.6  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  42.07 
 
 
786 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  32.73 
 
 
400 aa  76.6  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  32.75 
 
 
823 aa  76.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  30.93 
 
 
792 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  33.33 
 
 
530 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  33.53 
 
 
802 aa  74.7  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  33.92 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  30.88 
 
 
1667 aa  73.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  35.21 
 
 
1095 aa  73.6  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  34.15 
 
 
1387 aa  73.6  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  34.59 
 
 
996 aa  72.8  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  33.14 
 
 
684 aa  72  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  29.41 
 
 
439 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  32.8 
 
 
930 aa  70.9  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  31.91 
 
 
865 aa  70.1  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  32 
 
 
443 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  31.13 
 
 
777 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  29.95 
 
 
2552 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  32.76 
 
 
1328 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  31.48 
 
 
819 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  32.35 
 
 
938 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  33.12 
 
 
1814 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  35.09 
 
 
769 aa  65.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
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NC_007796  Mhun_0424  PKD  30 
 
 
1292 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  35.1 
 
 
1531 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  29.15 
 
 
586 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  32.02 
 
 
815 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0382453 
 
 
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NC_008942  Mlab_0510  hypothetical protein  32.19 
 
 
451 aa  64.3  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.644592 
 
 
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NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  39.47 
 
 
1230 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.791175 
 
 
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NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  34.39 
 
 
940 aa  63.2  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
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NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  33.33 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
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NC_007796  Mhun_0421  PKD  29.49 
 
 
952 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
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NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  38.89 
 
 
830 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
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