26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0826 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0826  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
159 aa  322  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0155823  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0610  coagulation factor 5/8 type domain protein  98.11 
 
 
159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0097  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  65.82 
 
 
159 aa  223  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4066  F5/8 type C domain-containing protein  65.82 
 
 
159 aa  223  9e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.639135 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4065  F5/8 type C domain-containing protein  65.19 
 
 
159 aa  223  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  33.61 
 
 
768 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  32.06 
 
 
912 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  31.85 
 
 
873 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  33.33 
 
 
748 aa  70.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  29.93 
 
 
818 aa  67.8  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  32 
 
 
674 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.32 
 
 
1246 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.33 
 
 
986 aa  52  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3272  hypothetical protein  28.07 
 
 
552 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000109169  hitchhiker  0.00653931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2478  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.58 
 
 
524 aa  47.4  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  28.78 
 
 
2095 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0803  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.68 
 
 
712 aa  45.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.969227  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  29.55 
 
 
1439 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.85 
 
 
695 aa  44.7  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  26.62 
 
 
2095 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.62 
 
 
820 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1016  glycoside hydrolase family protein  29.7 
 
 
880 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.41 
 
 
478 aa  41.2  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1751  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  29.21 
 
 
1088 aa  40.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865218  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  27.18 
 
 
1103 aa  40.8  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.69 
 
 
1212 aa  40.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>