54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2395 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0398  secreted protein  66.26 
 
 		 640 aa  738    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3740  secreted protein  63.54 
 
 		 640 aa  719    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253884  hitchhiker  0.00713649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2395  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 844 aa  1685    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527977  decreased coverage  0.000101055 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1669  secreted protein  54.5 
 
 		 622 aa  615  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180028  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  52.5 
 
 		 850 aa  575  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1718  secreted protein  55.62 
 
 		 562 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal  0.917754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1385  secreted protein  51.11 
 
 		 627 aa  556  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.195328  decreased coverage  0.000365007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.64 
 
 		 755 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.65 
 
 		 940 aa  538  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6657  secreted protein  48.19 
 
 		 645 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.84 
 
 		 962 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.19 
 
 		 722 aa  492  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.37 
 
 		 734 aa  462  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2668  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  44.44 
 
 		 652 aa  458  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  45.08 
 
 		 918 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  43.37 
 
 		 732 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1676  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  44.96 
 
 		 648 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  41.99 
 
 		 2117 aa  432  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0054  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.89 
 
 		 537 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0200  hypothetical protein  33.22 
 
 		 726 aa  293  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5709  hypothetical protein  32.57 
 
 		 722 aa  264  6.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  53.04 
 
 		 539 aa  163  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  32.16 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  35.11 
 
 		 762 aa  65.1  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  31.58 
 
 		 455 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 455 aa  62  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  32.45 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  31.14 
 
 		 455 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  30.48 
 
 		 455 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  31.79 
 
 		 455 aa  60.1  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  30.99 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  31.79 
 
 		 455 aa  60.1  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  30.99 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  28.79 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  28.65 
 
 		 458 aa  56.2  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.47 
 
 		 649 aa  55.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  28.72 
 
 		 458 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  28.88 
 
 		 456 aa  54.7  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  30.17 
 
 		 456 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1719  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  53.9  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.599653  normal  0.871033 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  30.77 
 
 		 445 aa  53.5  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  34.84 
 
 		 648 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.08 
 
 		 6885 aa  51.6  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  32.28 
 
 		 464 aa  50.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  30.37 
 
 		 465 aa  48.5  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 459 aa  47.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  27.22 
 
 		 680 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  31.25 
 
 		 743 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  33.15 
 
 		 1462 aa  47  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  36.26 
 
 		 749 aa  45.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2417  Fibronectin type III domain protein  41.94 
 
 		 485 aa  45.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  46.58 
 
 		 561 aa  44.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  31.11 
 
 		 2170 aa  44.7  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  37.5 
 
 		 660 aa  44.3  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>