22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1676 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1676  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 
648 aa  1280    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  50.89 
 
 
850 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.58 
 
 
962 aa  534  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.5 
 
 
734 aa  523  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.74 
 
 
722 aa  525  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  44.8 
 
 
918 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  45.28 
 
 
732 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0398  secreted protein  46.71 
 
 
640 aa  482  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0054  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  45.75 
 
 
537 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1385  secreted protein  45.26 
 
 
627 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.195328  decreased coverage  0.000365007 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3740  secreted protein  45.7 
 
 
640 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253884  hitchhiker  0.00713649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1669  secreted protein  47.59 
 
 
622 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180028  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1718  secreted protein  45.07 
 
 
562 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal  0.917754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2395  Fibronectin type III domain protein  44.96 
 
 
844 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527977  decreased coverage  0.000101055 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  42.23 
 
 
2117 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2668  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  42.31 
 
 
652 aa  420  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.31 
 
 
755 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.41 
 
 
940 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6657  secreted protein  39.21 
 
 
645 aa  385  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0200  hypothetical protein  37.19 
 
 
726 aa  314  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5709  hypothetical protein  36.76 
 
 
722 aa  296  7e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  25.45 
 
 
3409 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>