More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2446 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0107  beta-glucosidase protein  52.4 
 
 
656 aa  702    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0734039  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6710  Beta-glucosidase  53.77 
 
 
671 aa  682    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.593883 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4300  Beta-glucosidase  55.61 
 
 
669 aa  704    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0170448  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2541  glycoside hydrolase family 3 domain protein  77.52 
 
 
658 aa  1017    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3307  glycoside hydrolase family 3 domain protein  69.62 
 
 
659 aa  957    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2446  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
659 aa  1347    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.802964  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1719  glycoside hydrolase family protein  50.08 
 
 
640 aa  560  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2741  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.07 
 
 
670 aa  538  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2344  Xylan 1,4-beta-xylosidase  45.97 
 
 
608 aa  479  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3149  Beta-glucosidase  41.57 
 
 
663 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167157  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01804  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  41.83 
 
 
618 aa  433  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.497793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04360  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  40.03 
 
 
618 aa  430  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.117639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  40.23 
 
 
609 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3250  glycoside hydrolase family 3 protein  40.83 
 
 
588 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2687  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.99 
 
 
677 aa  360  5e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1258  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.4 
 
 
779 aa  339  7e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.539798 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0139  glycoside hydrolase family 3 protein  32.04 
 
 
753 aa  328  2.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000855243  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3059  xylan 1,4-beta-xylosidase  31.83 
 
 
754 aa  279  9e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0195747 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1591  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.7 
 
 
705 aa  266  1e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.241667  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07120  beta-glucosidase  33.47 
 
 
478 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20270  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.27 
 
 
675 aa  234  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.703616  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0471  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.12 
 
 
797 aa  230  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02260  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.56 
 
 
804 aa  230  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  26.07 
 
 
618 aa  176  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  29.45 
 
 
778 aa  172  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.88 
 
 
644 aa  172  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  29.42 
 
 
778 aa  171  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.28 
 
 
807 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.04 
 
 
736 aa  166  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  29.98 
 
 
805 aa  165  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.35 
 
 
771 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  29.69 
 
 
777 aa  164  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  31.25 
 
 
737 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  30.35 
 
 
790 aa  164  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.31 
 
 
762 aa  162  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  28.22 
 
 
1271 aa  160  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.01 
 
 
795 aa  159  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.64 
 
 
762 aa  158  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.06 
 
 
615 aa  158  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.24 
 
 
702 aa  156  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.49 
 
 
782 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1689  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.41 
 
 
619 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.28 
 
 
902 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  27.08 
 
 
1271 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  28.95 
 
 
758 aa  154  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  29.56 
 
 
787 aa  154  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.09 
 
 
783 aa  153  8e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  28.17 
 
 
678 aa  153  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  26.32 
 
 
1581 aa  151  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  29.11 
 
 
966 aa  151  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  26.37 
 
 
604 aa  150  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32 
 
 
765 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  27.97 
 
 
766 aa  147  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.32 
 
 
792 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.74 
 
 
760 aa  146  9e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  28.54 
 
 
739 aa  146  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  25.39 
 
 
612 aa  143  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  30.11 
 
 
727 aa  143  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.13 
 
 
784 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  30.11 
 
 
727 aa  143  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  28.22 
 
 
772 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  27.6 
 
 
808 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  29.52 
 
 
859 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.91 
 
 
765 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.82 
 
 
1564 aa  140  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0928  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.22 
 
 
780 aa  140  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1133  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.95 
 
 
886 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000321468  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1318  Beta-glucosidase  25.31 
 
 
880 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  28.5 
 
 
743 aa  140  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  28 
 
 
886 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3740  putative endoglucanase A  23.6 
 
 
599 aa  139  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.821502  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03794  glucan 1,4-beta-glucosidase  25.81 
 
 
850 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  28.77 
 
 
740 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1611  Beta-glucosidase  25.35 
 
 
811 aa  137  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  29.4 
 
 
750 aa  137  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2605  Beta-glucosidase  25.44 
 
 
866 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344943  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.06 
 
 
755 aa  137  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5444  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.62 
 
 
828 aa  137  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615677  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.22 
 
 
749 aa  137  9e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.41 
 
 
766 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1218  glycoside hydrolase family 3 protein  25.95 
 
 
886 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0296579  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.97 
 
 
754 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  29.45 
 
 
789 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.59 
 
 
752 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1185  glycoside hydrolase family 3 protein  25.5 
 
 
886 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00253974  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3172  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.5 
 
 
886 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00636451  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  30.18 
 
 
811 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  28.78 
 
 
1037 aa  134  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  27.85 
 
 
755 aa  134  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.06 
 
 
742 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  28.51 
 
 
750 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  28.47 
 
 
721 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  27.92 
 
 
773 aa  132  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  27.95 
 
 
802 aa  131  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.12 
 
 
760 aa  130  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4365  glycoside hydrolase family 3 protein  26.59 
 
 
608 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1149  glycoside hydrolase family 3 protein  25.08 
 
 
862 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.418597 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.34 
 
 
723 aa  130  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  32.73 
 
 
631 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1113  glycoside hydrolase family protein  25.94 
 
 
866 aa  128  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0994195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>