More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3149 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2344  Xylan 1,4-beta-xylosidase  54.14 
 
 		 608 aa  657    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04360  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  62.75 
 
 		 618 aa  781    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.117639 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3149  Beta-glucosidase  100 
 
 		 663 aa  1342    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  70.86 
 
 		 609 aa  858    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3250  glycoside hydrolase family 3 protein  52.09 
 
 		 588 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01804  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  49.32 
 
 		 618 aa  567  1e-160  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.497793 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6710  Beta-glucosidase  41.97 
 
 		 671 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.593883 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0107  beta-glucosidase protein  40.57 
 
 		 656 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0734039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3307  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.71 
 
 		 659 aa  443  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2446  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.57 
 
 		 659 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.802964  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2541  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.82 
 
 		 658 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4300  Beta-glucosidase  40.54 
 
 		 669 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0170448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2741  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.17 
 
 		 670 aa  398  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1719  glycoside hydrolase family protein  39.91 
 
 		 640 aa  393  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2687  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.58 
 
 		 677 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0139  glycoside hydrolase family 3 protein  33.24 
 
 		 753 aa  352  8e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000855243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3059  xylan 1,4-beta-xylosidase  36.11 
 
 		 754 aa  314  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195747 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1258  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.06 
 
 		 779 aa  303  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.539798 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07120  beta-glucosidase  37.68 
 
 		 478 aa  286  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20270  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.4 
 
 		 675 aa  273  9e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.703616  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1591  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.01 
 
 		 705 aa  265  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.241667  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0471  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.64 
 
 		 797 aa  249  9e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02260  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.41 
 
 		 804 aa  216  9e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  26.62 
 
 		 618 aa  174  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  28.81 
 
 		 737 aa  171  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  26.28 
 
 		 759 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.19 
 
 		 723 aa  163  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.89 
 
 		 736 aa  160  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.49 
 
 		 702 aa  160  8e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.09 
 
 		 762 aa  157  7e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  26.91 
 
 		 1581 aa  153  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  28.54 
 
 		 777 aa  153  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.83 
 
 		 644 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  26.02 
 
 		 808 aa  151  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.35 
 
 		 615 aa  151  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.57 
 
 		 795 aa  150  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  29.68 
 
 		 820 aa  150  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  29.05 
 
 		 758 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.77 
 
 		 782 aa  148  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  27.89 
 
 		 743 aa  148  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  29.49 
 
 		 790 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  29.01 
 
 		 778 aa  146  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  25.61 
 
 		 739 aa  144  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  24.55 
 
 		 743 aa  144  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  28.5 
 
 		 612 aa  144  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  30.89 
 
 		 678 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  25.23 
 
 		 755 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1689  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.64 
 
 		 619 aa  142  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  29.28 
 
 		 778 aa  142  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  27.26 
 
 		 751 aa  141  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  25.17 
 
 		 740 aa  141  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  29.2 
 
 		 966 aa  140  7e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  29.4 
 
 		 805 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  27.88 
 
 		 721 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30 
 
 		 902 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.29 
 
 		 766 aa  138  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  27.79 
 
 		 750 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  26.77 
 
 		 1271 aa  137  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  27.89 
 
 		 886 aa  137  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  29.53 
 
 		 859 aa  136  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  29.28 
 
 		 1271 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  26.96 
 
 		 618 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  27.67 
 
 		 604 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.76 
 
 		 1564 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.82 
 
 		 762 aa  135  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  25.75 
 
 		 750 aa  135  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  27.96 
 
 		 727 aa  135  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  27.96 
 
 		 727 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.87 
 
 		 756 aa  134  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.28 
 
 		 792 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 		 772 aa  131  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.17 
 
 		 771 aa  132  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.71 
 
 		 600 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  29.13 
 
 		 743 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  27 
 
 		 738 aa  128  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3725  glycosy hydrolase family protein  29.86 
 
 		 605 aa  126  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.69 
 
 		 807 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.55 
 
 		 784 aa  124  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.05 
 
 		 760 aa  124  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  29.67 
 
 		 811 aa  124  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.51 
 
 		 754 aa  123  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.07 
 
 		 783 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.21 
 
 		 751 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1303  glycoside hydrolase family 3 protein  24.27 
 
 		 826 aa  122  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75334  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  27.07 
 
 		 765 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.87 
 
 		 580 aa  120  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.52 
 
 		 543 aa  120  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.49 
 
 		 733 aa  120  7e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  25.71 
 
 		 787 aa  120  7.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.74 
 
 		 749 aa  120  7.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1611  Beta-glucosidase  24.42 
 
 		 811 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  27.19 
 
 		 772 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  28.02 
 
 		 768 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1149  glycoside hydrolase family 3 protein  24.81 
 
 		 862 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.418597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.5 
 
 		 558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  23.88 
 
 		 766 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1511  Beta-glucosidase  24.66 
 
 		 826 aa  118  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.95 
 
 		 751 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  29.42 
 
 		 631 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4662  glycoside hydrolase family 3 protein  29.11 
 
 		 793 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.576806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>