More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20270 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_20270  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  100 
 
 		 675 aa  1375    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.703616  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1591  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.26 
 
 		 705 aa  556  1e-157  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.241667  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2687  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.16 
 
 		 677 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3059  xylan 1,4-beta-xylosidase  35.67 
 
 		 754 aa  315  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195747 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2344  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.32 
 
 		 608 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3149  Beta-glucosidase  34.4 
 
 		 663 aa  300  8e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167157  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4300  Beta-glucosidase  34.36 
 
 		 669 aa  299  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0170448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0139  glycoside hydrolase family 3 protein  30.92 
 
 		 753 aa  299  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000855243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6710  Beta-glucosidase  32.03 
 
 		 671 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.593883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04360  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.09 
 
 		 618 aa  277  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.117639 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3307  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.47 
 
 		 659 aa  269  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.44 
 
 		 609 aa  263  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2741  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.44 
 
 		 670 aa  260  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3250  glycoside hydrolase family 3 protein  33.44 
 
 		 588 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2446  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.27 
 
 		 659 aa  259  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.802964  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01804  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  30.69 
 
 		 618 aa  258  3e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.497793 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07120  beta-glucosidase  31.98 
 
 		 478 aa  250  8e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0107  beta-glucosidase protein  28.53 
 
 		 656 aa  244  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0734039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2541  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.17 
 
 		 658 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1258  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.46 
 
 		 779 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.539798 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1719  glycoside hydrolase family protein  29.07 
 
 		 640 aa  210  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0471  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.94 
 
 		 797 aa  182  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02260  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  30.81 
 
 		 804 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.31 
 
 		 762 aa  150  9e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  26.94 
 
 		 739 aa  148  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  30.98 
 
 		 604 aa  139  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  24.78 
 
 		 743 aa  135  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  26.81 
 
 		 790 aa  134  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  24.93 
 
 		 778 aa  134  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  24.97 
 
 		 778 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.13 
 
 		 807 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  31.93 
 
 		 768 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.69 
 
 		 782 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.93 
 
 		 736 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  27.38 
 
 		 750 aa  128  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.59 
 
 		 795 aa  127  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  24.68 
 
 		 777 aa  127  9e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  26.7 
 
 		 758 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  32.87 
 
 		 808 aa  126  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.64 
 
 		 751 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  27.35 
 
 		 727 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  27.18 
 
 		 727 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.6 
 
 		 902 aa  124  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  24.68 
 
 		 618 aa  124  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  26.47 
 
 		 743 aa  124  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.18 
 
 		 769 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.34 
 
 		 615 aa  122  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  29.02 
 
 		 772 aa  120  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  24.43 
 
 		 740 aa  120  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  28.34 
 
 		 737 aa  120  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  26.71 
 
 		 738 aa  120  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.02 
 
 		 600 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.26 
 
 		 754 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  25.6 
 
 		 750 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  28.19 
 
 		 765 aa  117  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.58 
 
 		 702 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26 
 
 		 769 aa  117  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  23.96 
 
 		 759 aa  116  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.75 
 
 		 742 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  30.87 
 
 		 723 aa  117  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.18 
 
 		 760 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  24.03 
 
 		 805 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  29.52 
 
 		 763 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.21 
 
 		 762 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  28.99 
 
 		 764 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  24.92 
 
 		 765 aa  115  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  26.32 
 
 		 859 aa  114  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  28.61 
 
 		 743 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.82 
 
 		 733 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.62 
 
 		 756 aa  112  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1800  beta-glucosidase  27 
 
 		 739 aa  112  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.85 
 
 		 760 aa  112  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  28.5 
 
 		 763 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  28.94 
 
 		 774 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  28.5 
 
 		 763 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.18 
 
 		 766 aa  111  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  24.54 
 
 		 820 aa  111  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  25.43 
 
 		 612 aa  110  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1732  glycoside hydrolase family 3 protein  29.49 
 
 		 740 aa  110  9.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.99 
 
 		 771 aa  110  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  28.33 
 
 		 753 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  27.09 
 
 		 763 aa  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.17 
 
 		 783 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  27.36 
 
 		 766 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.35 
 
 		 749 aa  108  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  26.68 
 
 		 966 aa  108  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  29.19 
 
 		 769 aa  108  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  27.85 
 
 		 763 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.27 
 
 		 644 aa  107  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.53 
 
 		 752 aa  107  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  27.76 
 
 		 765 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1689  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.4 
 
 		 619 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  26.99 
 
 		 721 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  32.35 
 
 		 811 aa  106  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  24.82 
 
 		 765 aa  105  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.09 
 
 		 543 aa  105  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  26.52 
 
 		 886 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  27.8 
 
 		 765 aa  105  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  27.8 
 
 		 765 aa  105  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  27.8 
 
 		 765 aa  105  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>