More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02260 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02260  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  100 
 
 		 804 aa  1618    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0471  glycoside hydrolase family 3 domain protein  59.32 
 
 		 797 aa  909    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1258  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.51 
 
 		 779 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.539798 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6710  Beta-glucosidase  34.94 
 
 		 671 aa  240  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.593883 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2446  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.56 
 
 		 659 aa  230  6e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.802964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3307  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.15 
 
 		 659 aa  230  8e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0107  beta-glucosidase protein  31.41 
 
 		 656 aa  227  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0734039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2541  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.63 
 
 		 658 aa  219  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3149  Beta-glucosidase  33.41 
 
 		 663 aa  216  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.45 
 
 		 609 aa  214  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3250  glycoside hydrolase family 3 protein  36.81 
 
 		 588 aa  213  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2344  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.26 
 
 		 608 aa  213  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04360  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.02 
 
 		 618 aa  212  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.117639 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4300  Beta-glucosidase  32.42 
 
 		 669 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0170448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1591  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.93 
 
 		 705 aa  192  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.241667  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3059  xylan 1,4-beta-xylosidase  25.07 
 
 		 754 aa  189  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195747 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01804  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  31.94 
 
 		 618 aa  189  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.497793 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1719  glycoside hydrolase family protein  31.68 
 
 		 640 aa  183  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2687  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.3 
 
 		 677 aa  178  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20270  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  30.81 
 
 		 675 aa  155  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.703616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0139  glycoside hydrolase family 3 protein  27.12 
 
 		 753 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000855243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07120  beta-glucosidase  30.23 
 
 		 478 aa  146  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2741  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.01 
 
 		 670 aa  141  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  25.45 
 
 		 772 aa  109  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  24.87 
 
 		 727 aa  105  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  24.87 
 
 		 727 aa  105  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.63 
 
 		 784 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  27.53 
 
 		 777 aa  103  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.63 
 
 		 755 aa  102  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  30.09 
 
 		 790 aa  99  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.86 
 
 		 760 aa  96.3  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  32.03 
 
 		 737 aa  95.1  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  28.35 
 
 		 778 aa  94.7  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  28.35 
 
 		 778 aa  94.4  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.91 
 
 		 795 aa  92.4  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  22.69 
 
 		 755 aa  91.7  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  28.08 
 
 		 808 aa  91.3  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 		 805 aa  90.1  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  27.19 
 
 		 743 aa  90.1  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4662  glycoside hydrolase family 3 protein  37.57 
 
 		 793 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.576806 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.54 
 
 		 702 aa  89.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.43 
 
 		 783 aa  88.6  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.85 
 
 		 771 aa  87.8  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.21 
 
 		 749 aa  87.4  9e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  28.34 
 
 		 811 aa  86.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.47 
 
 		 902 aa  87.4  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  29.43 
 
 		 750 aa  86.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.94 
 
 		 736 aa  86.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  27.67 
 
 		 743 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.82 
 
 		 757 aa  85.5  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.76 
 
 		 782 aa  84.7  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.22 
 
 		 760 aa  84.3  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.93 
 
 		 644 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  28.25 
 
 		 678 aa  84  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.19 
 
 		 762 aa  83.2  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  26.35 
 
 		 740 aa  82  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  24.77 
 
 		 1271 aa  82  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  27.92 
 
 		 612 aa  81.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.32 
 
 		 807 aa  81.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  27.33 
 
 		 886 aa  81.6  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25 
 
 		 756 aa  81.3  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  27.76 
 
 		 802 aa  80.9  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.41 
 
 		 766 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.91 
 
 		 792 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  24.04 
 
 		 743 aa  80.9  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  25.06 
 
 		 618 aa  79.7  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.21 
 
 		 751 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  24.73 
 
 		 721 aa  79  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.41 
 
 		 773 aa  78.6  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2072  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.28 
 
 		 900 aa  78.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177035  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  24.6 
 
 		 759 aa  78.2  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.86 
 
 		 801 aa  78.2  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.24 
 
 		 742 aa  77.4  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  24.6 
 
 		 758 aa  77.4  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  24.12 
 
 		 1271 aa  77.4  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1113  glycoside hydrolase family protein  27.21 
 
 		 866 aa  76.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0994195  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1511  Beta-glucosidase  24.31 
 
 		 826 aa  76.3  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  23.4 
 
 		 739 aa  75.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  27.62 
 
 		 966 aa  75.9  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.23 
 
 		 752 aa  75.9  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 		 769 aa  75.5  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.17 
 
 		 760 aa  75.1  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  26.22 
 
 		 787 aa  75.1  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.26 
 
 		 762 aa  74.7  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.65 
 
 		 806 aa  74.7  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.14 
 
 		 723 aa  73.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  25.08 
 
 		 750 aa  73.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  30.68 
 
 		 766 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 		 772 aa  73.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 		 769 aa  73.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  24.31 
 
 		 820 aa  72.8  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1826  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.04 
 
 		 771 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.75 
 
 		 768 aa  72.4  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01600  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  27.16 
 
 		 798 aa  72.4  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  26.88 
 
 		 604 aa  72.4  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  25.25 
 
 		 1581 aa  72  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  26.85 
 
 		 859 aa  72.4  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.76 
 
 		 765 aa  72  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  23.09 
 
 		 799 aa  71.6  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  36.52 
 
 		 764 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>