More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3250 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3250  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 588 aa  1183    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2344  Xylan 1,4-beta-xylosidase  55.92 
 
 		 608 aa  626  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3149  Beta-glucosidase  52.09 
 
 		 663 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167157  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01804  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  49.66 
 
 		 618 aa  563  1.0000000000000001e-159  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.497793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  51.57 
 
 		 609 aa  561  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04360  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  50.84 
 
 		 618 aa  553  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.117639 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3307  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.93 
 
 		 659 aa  431  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6710  Beta-glucosidase  40.26 
 
 		 671 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.593883 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2446  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.83 
 
 		 659 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.802964  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4300  Beta-glucosidase  41.05 
 
 		 669 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0170448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2541  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.67 
 
 		 658 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2687  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.22 
 
 		 677 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0107  beta-glucosidase protein  37.44 
 
 		 656 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0734039  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1719  glycoside hydrolase family protein  39.43 
 
 		 640 aa  355  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2741  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.02 
 
 		 670 aa  349  6e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3059  xylan 1,4-beta-xylosidase  34.28 
 
 		 754 aa  284  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195747 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0139  glycoside hydrolase family 3 protein  30.52 
 
 		 753 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000855243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07120  beta-glucosidase  34.73 
 
 		 478 aa  270  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1258  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.87 
 
 		 779 aa  263  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.539798 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20270  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.75 
 
 		 675 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.703616  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1591  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.77 
 
 		 705 aa  237  4e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.241667  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0471  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.29 
 
 		 797 aa  221  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02260  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.2 
 
 		 804 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  31.24 
 
 		 737 aa  186  9e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.89 
 
 		 762 aa  179  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  27.97 
 
 		 618 aa  179  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  30.2 
 
 		 759 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  25.51 
 
 		 739 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  28.39 
 
 		 1581 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.5 
 
 		 702 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.43 
 
 		 795 aa  160  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  33.25 
 
 		 966 aa  159  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.34 
 
 		 736 aa  155  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  30.33 
 
 		 777 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.43 
 
 		 615 aa  152  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  27.76 
 
 		 805 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.66 
 
 		 756 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  28.18 
 
 		 604 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  29.17 
 
 		 743 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  28.75 
 
 		 721 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  25.74 
 
 		 743 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  25.78 
 
 		 758 aa  147  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  27.79 
 
 		 727 aa  147  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  29.82 
 
 		 886 aa  147  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  27.79 
 
 		 727 aa  147  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.05 
 
 		 807 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.01 
 
 		 644 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.25 
 
 		 723 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  29.51 
 
 		 778 aa  141  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  33.33 
 
 		 768 aa  141  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  30.64 
 
 		 751 aa  141  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  26.75 
 
 		 808 aa  140  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.79 
 
 		 742 aa  140  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  25.62 
 
 		 755 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  29.29 
 
 		 778 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  30.39 
 
 		 790 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.74 
 
 		 1564 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  26.74 
 
 		 750 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  30.12 
 
 		 750 aa  138  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.83 
 
 		 902 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.23 
 
 		 751 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  28.97 
 
 		 772 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  26.54 
 
 		 612 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  26.28 
 
 		 678 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.85 
 
 		 766 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.57 
 
 		 771 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.94 
 
 		 782 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  27.71 
 
 		 740 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  27.78 
 
 		 820 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1689  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.52 
 
 		 619 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  26.42 
 
 		 1271 aa  132  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  29.9 
 
 		 765 aa  131  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.35 
 
 		 792 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  32.94 
 
 		 764 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.58 
 
 		 760 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  28.67 
 
 		 787 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.34 
 
 		 784 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  28.08 
 
 		 743 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.31 
 
 		 783 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  31.05 
 
 		 811 aa  128  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  24.54 
 
 		 766 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.85 
 
 		 760 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.96 
 
 		 751 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.74 
 
 		 762 aa  125  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.6 
 
 		 600 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  25.08 
 
 		 763 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.32 
 
 		 752 aa  124  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  25.89 
 
 		 763 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  25.89 
 
 		 763 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  27.23 
 
 		 765 aa  124  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  25.39 
 
 		 759 aa  123  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.04 
 
 		 580 aa  123  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  26.92 
 
 		 738 aa  123  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  25.55 
 
 		 763 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3725  glycosy hydrolase family protein  29.48 
 
 		 605 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.5 
 
 		 765 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  30.97 
 
 		 859 aa  122  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  25.47 
 
 		 763 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  24.84 
 
 		 1271 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.08 
 
 		 749 aa  121  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>