More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2741 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2741  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 670 aa  1326    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6710  Beta-glucosidase  46.55 
 
 		 671 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.593883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3307  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.09 
 
 		 659 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2541  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.41 
 
 		 658 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0107  beta-glucosidase protein  44.65 
 
 		 656 aa  538  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0734039  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2446  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.72 
 
 		 659 aa  538  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.802964  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4300  Beta-glucosidase  45.51 
 
 		 669 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0170448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1719  glycoside hydrolase family protein  45.11 
 
 		 640 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2344  Xylan 1,4-beta-xylosidase  42.7 
 
 		 608 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  42.16 
 
 		 609 aa  412  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3149  Beta-glucosidase  39.17 
 
 		 663 aa  398  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167157  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01804  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  37.77 
 
 		 618 aa  387  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.497793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04360  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.81 
 
 		 618 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.117639 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3250  glycoside hydrolase family 3 protein  37.69 
 
 		 588 aa  337  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2687  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32 
 
 		 677 aa  336  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1258  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.87 
 
 		 779 aa  323  7e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.539798 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0139  glycoside hydrolase family 3 protein  29.99 
 
 		 753 aa  295  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000855243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3059  xylan 1,4-beta-xylosidase  32.36 
 
 		 754 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195747 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07120  beta-glucosidase  33.86 
 
 		 478 aa  246  9e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1591  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.94 
 
 		 705 aa  243  7e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.241667  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20270  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.44 
 
 		 675 aa  236  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.703616  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0471  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.23 
 
 		 797 aa  233  8.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02260  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.5 
 
 		 804 aa  196  8.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  28.25 
 
 		 618 aa  187  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  30.38 
 
 		 737 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.91 
 
 		 762 aa  171  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.45 
 
 		 736 aa  164  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.3 
 
 		 615 aa  163  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.81 
 
 		 644 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  24.71 
 
 		 743 aa  154  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  25.44 
 
 		 1581 aa  153  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.84 
 
 		 762 aa  153  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  24.63 
 
 		 740 aa  149  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  27.05 
 
 		 886 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.95 
 
 		 782 aa  148  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  25.11 
 
 		 758 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  22.79 
 
 		 777 aa  144  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  28.26 
 
 		 966 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  26.2 
 
 		 727 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  26.2 
 
 		 727 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  27.93 
 
 		 1271 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.51 
 
 		 702 aa  141  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  28.59 
 
 		 764 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  25.3 
 
 		 739 aa  140  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  24.96 
 
 		 743 aa  140  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  27.17 
 
 		 790 aa  140  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  28.63 
 
 		 778 aa  139  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  26.26 
 
 		 750 aa  137  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.89 
 
 		 795 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  27.62 
 
 		 1271 aa  137  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.17 
 
 		 807 aa  137  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  27.69 
 
 		 772 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.65 
 
 		 757 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  25.38 
 
 		 751 aa  135  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 		 805 aa  135  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1218  glycoside hydrolase family 3 protein  25.69 
 
 		 886 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0296579  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03794  glucan 1,4-beta-glucosidase  25.18 
 
 		 850 aa  134  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2072  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.95 
 
 		 900 aa  134  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  28.57 
 
 		 778 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.91 
 
 		 742 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  24.71 
 
 		 743 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  26.22 
 
 		 787 aa  132  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.79 
 
 		 756 aa  132  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.37 
 
 		 902 aa  132  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5523  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.88 
 
 		 714 aa  131  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131263  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1185  glycoside hydrolase family 3 protein  25.69 
 
 		 886 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00253974  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3172  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.69 
 
 		 886 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00636451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1133  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.54 
 
 		 886 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000321468  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.97 
 
 		 755 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.03 
 
 		 760 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.17 
 
 		 771 aa  129  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.55 
 
 		 783 aa  128  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.46 
 
 		 1564 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  29.85 
 
 		 678 aa  128  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2605  Beta-glucosidase  25.31 
 
 		 866 aa  127  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344943  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.96 
 
 		 769 aa  126  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  25.91 
 
 		 721 aa  127  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.48 
 
 		 760 aa  126  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  28.25 
 
 		 763 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.15 
 
 		 733 aa  125  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00680  glucan 1,4-beta-glucosidase  25.23 
 
 		 844 aa  124  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1439  glycoside hydrolase family 3 protein  25.53 
 
 		 850 aa  124  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  23.51 
 
 		 755 aa  123  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  28.93 
 
 		 811 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  30.48 
 
 		 765 aa  123  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.36 
 
 		 769 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1318  Beta-glucosidase  24.56 
 
 		 880 aa  122  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1149  glycoside hydrolase family 3 protein  25.13 
 
 		 862 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.418597 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.75 
 
 		 733 aa  120  7e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  22.87 
 
 		 1072 aa  120  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  26.76 
 
 		 612 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  25.91 
 
 		 759 aa  120  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  29.73 
 
 		 789 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  25 
 
 		 765 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  25 
 
 		 765 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1611  Beta-glucosidase  25.47 
 
 		 811 aa  119  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  25 
 
 		 765 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1689  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.24 
 
 		 619 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  25.26 
 
 		 755 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  25 
 
 		 765 aa  119  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>