More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0471 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0471  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 797 aa  1618    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02260  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  59.32 
 
 		 804 aa  908    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1258  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.72 
 
 		 779 aa  475  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.539798 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6710  Beta-glucosidase  38.14 
 
 		 671 aa  258  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.593883 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0107  beta-glucosidase protein  34.62 
 
 		 656 aa  254  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0734039  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.31 
 
 		 609 aa  252  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3149  Beta-glucosidase  34.64 
 
 		 663 aa  250  9e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167157  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3307  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.05 
 
 		 659 aa  247  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2344  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.89 
 
 		 608 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2741  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.23 
 
 		 670 aa  233  8.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2541  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.99 
 
 		 658 aa  231  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2446  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.12 
 
 		 659 aa  230  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.802964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2687  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.38 
 
 		 677 aa  227  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3250  glycoside hydrolase family 3 protein  35.29 
 
 		 588 aa  221  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4300  Beta-glucosidase  32.78 
 
 		 669 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0170448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1591  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.35 
 
 		 705 aa  213  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.241667  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04360  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.96 
 
 		 618 aa  213  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.117639 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01804  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  37.21 
 
 		 618 aa  210  7e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.497793 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1719  glycoside hydrolase family protein  33.49 
 
 		 640 aa  208  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3059  xylan 1,4-beta-xylosidase  29.47 
 
 		 754 aa  193  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195747 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0139  glycoside hydrolase family 3 protein  27.43 
 
 		 753 aa  167  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000855243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20270  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  29.94 
 
 		 675 aa  157  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.703616  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07120  beta-glucosidase  31.86 
 
 		 478 aa  143  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  26.65 
 
 		 805 aa  119  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.17 
 
 		 771 aa  115  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  24.38 
 
 		 808 aa  111  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  24.91 
 
 		 743 aa  111  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  24.27 
 
 		 743 aa  106  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.94 
 
 		 755 aa  105  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  24.66 
 
 		 777 aa  105  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  25.63 
 
 		 750 aa  104  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  24.2 
 
 		 772 aa  104  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  24.93 
 
 		 737 aa  102  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.3 
 
 		 792 aa  102  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  25.87 
 
 		 790 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  22.46 
 
 		 745 aa  102  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.53 
 
 		 760 aa  102  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.86 
 
 		 807 aa  101  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  23.3 
 
 		 727 aa  101  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  23.3 
 
 		 727 aa  100  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.21 
 
 		 762 aa  100  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  27.07 
 
 		 772 aa  98.2  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  30.32 
 
 		 721 aa  97.8  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.23 
 
 		 782 aa  97.8  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  26.61 
 
 		 859 aa  97.4  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  24.79 
 
 		 787 aa  95.9  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  26.16 
 
 		 778 aa  96.3  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  26.16 
 
 		 778 aa  95.1  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.8 
 
 		 784 aa  94.7  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  26.33 
 
 		 886 aa  94.7  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.67 
 
 		 752 aa  94.4  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  26.69 
 
 		 618 aa  93.6  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  28.43 
 
 		 755 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  27.84 
 
 		 743 aa  93.6  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  26.67 
 
 		 740 aa  93.2  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  31.17 
 
 		 751 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.54 
 
 		 795 aa  92.4  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.46 
 
 		 762 aa  92.4  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4662  glycoside hydrolase family 3 protein  29.87 
 
 		 793 aa  92  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.576806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.37 
 
 		 751 aa  91.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.79 
 
 		 769 aa  91.7  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  27.38 
 
 		 604 aa  91.7  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25 
 
 		 736 aa  90.9  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  27.69 
 
 		 966 aa  89.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  28.06 
 
 		 789 aa  90.1  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  29.33 
 
 		 811 aa  88.2  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  28.74 
 
 		 764 aa  88.2  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3585  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.58 
 
 		 811 aa  88.2  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.74 
 
 		 1564 aa  88.2  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.13 
 
 		 644 aa  87.8  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.02 
 
 		 757 aa  87.4  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.04 
 
 		 902 aa  87.4  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.21 
 
 		 766 aa  87  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.91 
 
 		 749 aa  86.7  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.89 
 
 		 760 aa  87  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.18 
 
 		 783 aa  85.9  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.27 
 
 		 768 aa  85.9  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  24.12 
 
 		 766 aa  85.1  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  30.93 
 
 		 773 aa  84.7  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  23.67 
 
 		 801 aa  85.1  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  25 
 
 		 763 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  23.34 
 
 		 760 aa  85.1  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.41 
 
 		 702 aa  85.1  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.49 
 
 		 765 aa  85.1  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1113  glycoside hydrolase family protein  27.76 
 
 		 866 aa  84.3  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0994195  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  24.72 
 
 		 763 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  24.72 
 
 		 763 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0928  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.02 
 
 		 780 aa  82.8  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.4 
 
 		 754 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  25.63 
 
 		 758 aa  82.8  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  25.7 
 
 		 678 aa  83.2  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  25 
 
 		 763 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.73 
 
 		 769 aa  82  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  25.51 
 
 		 765 aa  82  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  22.76 
 
 		 774 aa  81.6  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.96 
 
 		 806 aa  81.6  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  27.3 
 
 		 769 aa  81.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  22.48 
 
 		 756 aa  81.6  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.14 
 
 		 768 aa  80.9  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  24.18 
 
 		 750 aa  80.5  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>