More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_07120 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_07120  beta-glucosidase  100 
 
 		 478 aa  977    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0139  glycoside hydrolase family 3 protein  52.41 
 
 		 753 aa  519  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000855243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3059  xylan 1,4-beta-xylosidase  50.09 
 
 		 754 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195747 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2687  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.24 
 
 		 677 aa  362  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  0.221922 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01804  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  36.89 
 
 		 618 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.497793 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2344  Xylan 1,4-beta-xylosidase  36.89 
 
 		 608 aa  294  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3149  Beta-glucosidase  37.68 
 
 		 663 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167157  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6710  Beta-glucosidase  34.46 
 
 		 671 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.593883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3250  glycoside hydrolase family 3 protein  34.31 
 
 		 588 aa  262  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04360  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.41 
 
 		 618 aa  262  8.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.117639 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4300  Beta-glucosidase  34.38 
 
 		 669 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0170448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.05 
 
 		 609 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1591  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.16 
 
 		 705 aa  256  7e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.241667  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3307  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.53 
 
 		 659 aa  250  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2741  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.73 
 
 		 670 aa  246  8e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2446  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.47 
 
 		 659 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.802964  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2541  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.59 
 
 		 658 aa  227  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20270  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.98 
 
 		 675 aa  223  8e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.703616  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0107  beta-glucosidase protein  29.82 
 
 		 656 aa  220  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0734039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1258  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.88 
 
 		 779 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.539798 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1719  glycoside hydrolase family protein  29.54 
 
 		 640 aa  191  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  31.32 
 
 		 737 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02260  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  30.23 
 
 		 804 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0471  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.86 
 
 		 797 aa  143  8e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.54 
 
 		 615 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.55 
 
 		 807 aa  140  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.92 
 
 		 762 aa  136  9e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.27 
 
 		 736 aa  133  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  26.43 
 
 		 739 aa  133  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.97 
 
 		 644 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  27.76 
 
 		 618 aa  130  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.56 
 
 		 782 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  27.03 
 
 		 759 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  26.65 
 
 		 758 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.34 
 
 		 702 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  26.57 
 
 		 727 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  26.57 
 
 		 727 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  34.23 
 
 		 772 aa  123  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.28 
 
 		 723 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  30.21 
 
 		 743 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.29 
 
 		 902 aa  121  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.09 
 
 		 783 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.13 
 
 		 795 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  31.77 
 
 		 778 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  31.77 
 
 		 778 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  27.2 
 
 		 808 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  27.45 
 
 		 1271 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.03 
 
 		 766 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  30.29 
 
 		 738 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.11 
 
 		 600 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.63 
 
 		 754 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  31.62 
 
 		 743 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.82 
 
 		 751 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  27.62 
 
 		 777 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  26.19 
 
 		 743 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  27.18 
 
 		 604 aa  114  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  27.03 
 
 		 1271 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  27.81 
 
 		 763 aa  113  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.69 
 
 		 755 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.23 
 
 		 769 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  31.8 
 
 		 763 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  31.8 
 
 		 763 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  32.62 
 
 		 764 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  30.18 
 
 		 750 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  31.8 
 
 		 763 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2072  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.1 
 
 		 900 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177035  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  28.38 
 
 		 740 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  32.07 
 
 		 805 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.09 
 
 		 769 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  31.29 
 
 		 820 aa  110  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.8 
 
 		 771 aa  110  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  31.35 
 
 		 886 aa  110  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5523  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.49 
 
 		 714 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1318  Beta-glucosidase  28.53 
 
 		 880 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  31.45 
 
 		 612 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  29.49 
 
 		 774 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.96 
 
 		 760 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.76 
 
 		 765 aa  108  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.97 
 
 		 752 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  30.77 
 
 		 763 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  29.97 
 
 		 790 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  27.55 
 
 		 1581 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3725  glycosy hydrolase family protein  24.39 
 
 		 605 aa  107  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  29.55 
 
 		 755 aa  106  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.47 
 
 		 762 aa  106  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.72 
 
 		 757 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  28.92 
 
 		 763 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.82 
 
 		 749 aa  106  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.53 
 
 		 799 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.01 
 
 		 792 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  26.57 
 
 		 768 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  28.77 
 
 		 766 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 		 751 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.43 
 
 		 733 aa  103  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  30.95 
 
 		 772 aa  103  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  28.89 
 
 		 721 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  28.47 
 
 		 787 aa  102  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  25.73 
 
 		 618 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.9 
 
 		 760 aa  102  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  28.6 
 
 		 723 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>